Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV0

LRRC46, Leucine-rich repeat-containing protein 46, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC46Q96FV0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC46Q96FV0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC46Q96FV0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC46Q96FV0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC46Q96FV0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC46Q96FV0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC46Q96FV0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC46Q96FV0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC46Q96FV0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC46Q96FV0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC46Q96FV0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC46Q96FV0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC46Q96FV0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC46Q96FV0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC46Q96FV0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC46Q96FV0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC46Q96FV0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC46Q96FV0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC46Q96FV0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC46Q96FV0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC46Q96FV0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC46Q96FV0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC46Q96FV0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC46Q96FV0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC46Q96FV0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC46Q96FV0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC46Q96FV0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC46Q96FV0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC46Q96FV0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC46Q96FV0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC46Q96FV0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC46Q96FV0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC46Q96FV0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC46Q96FV0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC46Q96FV0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC46Q96FV0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC46Q96FV0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC46Q96FV0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC46Q96FV0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC46Q96FV0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC46Q96FV0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC46Q96FV0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC46Q96FV0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC46Q96FV0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC46Q96FV0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC46Q96FV0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC46Q96FV0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC46Q96FV0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC46Q96FV0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC46Q96FV0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC46Q96FV0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC46Q96FV0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC46Q96FV0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC46Q96FV0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC46Q96FV0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC46Q96FV0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC46Q96FV0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC46Q96FV0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC46Q96FV0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC46Q96FV0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC46Q96FV0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC46Q96FV0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC46Q96FV0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC46Q96FV0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC46Q96FV0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC46Q96FV0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC46Q96FV0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC46Q96FV0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC46Q96FV0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC46Q96FV0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC46Q96FV0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC46Q96FV0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC46Q96FV0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC46Q96FV0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC46Q96FV0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC46Q96FV0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC46Q96FV0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC46Q96FV0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC46Q96FV0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC46Q96FV0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC46Q96FV0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC46Q96FV0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC46Q96FV0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC46Q96FV0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC46Q96FV0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC46Q96FV0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC46Q96FV0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC46Q96FV0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC46Q96FV0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC46Q96FV0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC46Q96FV0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC46Q96FV0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC46Q96FV0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC46Q96FV0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC46Q96FV0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC46Q96FV0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC46Q96FV0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC46Q96FV0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC46Q96FV0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC46Q96FV0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms