Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE7

PIK3IP1, Phosphoinositide-3-kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3IP1Q96FE7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3IP1Q96FE7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3IP1Q96FE7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3IP1Q96FE7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3IP1Q96FE7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3IP1Q96FE7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3IP1Q96FE7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3IP1Q96FE7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3IP1Q96FE7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3IP1Q96FE7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3IP1Q96FE7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3IP1Q96FE7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3IP1Q96FE7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3IP1Q96FE7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3IP1Q96FE7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3IP1Q96FE7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3IP1Q96FE7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3IP1Q96FE7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3IP1Q96FE7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PIK3IP1Q96FE7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PIK3IP1Q96FE7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3IP1Q96FE7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3IP1Q96FE7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3IP1Q96FE7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3IP1Q96FE7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3IP1Q96FE7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3IP1Q96FE7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3IP1Q96FE7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3IP1Q96FE7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3IP1Q96FE7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3IP1Q96FE7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3IP1Q96FE7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3IP1Q96FE7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3IP1Q96FE7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3IP1Q96FE7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3IP1Q96FE7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3IP1Q96FE7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3IP1Q96FE7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3IP1Q96FE7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3IP1Q96FE7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3IP1Q96FE7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3IP1Q96FE7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3IP1Q96FE7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3IP1Q96FE7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3IP1Q96FE7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3IP1Q96FE7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIK3IP1Q96FE7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3IP1Q96FE7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIK3IP1Q96FE7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIK3IP1Q96FE7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3IP1Q96FE7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3IP1Q96FE7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3IP1Q96FE7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3IP1Q96FE7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3IP1Q96FE7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIK3IP1Q96FE7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3IP1Q96FE7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3IP1Q96FE7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3IP1Q96FE7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3IP1Q96FE7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3IP1Q96FE7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3IP1Q96FE7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3IP1Q96FE7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3IP1Q96FE7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3IP1Q96FE7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3IP1Q96FE7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3IP1Q96FE7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3IP1Q96FE7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3IP1Q96FE7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3IP1Q96FE7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3IP1Q96FE7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3IP1Q96FE7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3IP1Q96FE7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3IP1Q96FE7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3IP1Q96FE7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3IP1Q96FE7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3IP1Q96FE7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3IP1Q96FE7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3IP1Q96FE7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3IP1Q96FE7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3IP1Q96FE7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3IP1Q96FE7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3IP1Q96FE7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3IP1Q96FE7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PIK3IP1Q96FE7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3IP1Q96FE7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3IP1Q96FE7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3IP1Q96FE7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3IP1Q96FE7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3IP1Q96FE7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3IP1Q96FE7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3IP1Q96FE7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3IP1Q96FE7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3IP1Q96FE7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3IP1Q96FE7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3IP1Q96FE7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3IP1Q96FE7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3IP1Q96FE7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3IP1Q96FE7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3IP1Q96FE7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms