Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SIRT1Q96EB6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SIRT1Q96EB6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SIRT1Q96EB6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
SIRT1Q96EB6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
SIRT1Q96EB6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
SIRT1Q96EB6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
SIRT1Q96EB6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
SIRT1Q96EB6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
SIRT1Q96EB6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SIRT1Q96EB6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SIRT1Q96EB6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SIRT1Q96EB6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SIRT1Q96EB6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SIRT1Q96EB6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SIRT1Q96EB6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SIRT1Q96EB6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SIRT1Q96EB6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SIRT1Q96EB6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SIRT1Q96EB6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SIRT1Q96EB6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SIRT1Q96EB6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SIRT1Q96EB6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SIRT1Q96EB6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
SIRT1Q96EB6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
SIRT1Q96EB6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SIRT1Q96EB6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SIRT1Q96EB6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SIRT1Q96EB6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SIRT1Q96EB6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SIRT1Q96EB6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SIRT1Q96EB6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SIRT1Q96EB6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SIRT1Q96EB6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SIRT1Q96EB6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SIRT1Q96EB6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SIRT1Q96EB6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SIRT1Q96EB6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
SIRT1Q96EB6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
SIRT1Q96EB6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SIRT1Q96EB6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SIRT1Q96EB6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SIRT1Q96EB6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SIRT1Q96EB6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SIRT1Q96EB6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SIRT1Q96EB6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SIRT1Q96EB6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SIRT1Q96EB6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
SIRT1Q96EB6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
SIRT1Q96EB6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SIRT1Q96EB6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
SIRT1Q96EB6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SIRT1Q96EB6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SIRT1Q96EB6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SIRT1Q96EB6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SIRT1Q96EB6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SIRT1Q96EB6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
SIRT1Q96EB6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
SIRT1Q96EB6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SIRT1Q96EB6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SIRT1Q96EB6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SIRT1Q96EB6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SIRT1Q96EB6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SIRT1Q96EB6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SIRT1Q96EB6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
SIRT1Q96EB6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SIRT1Q96EB6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SIRT1Q96EB6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SIRT1Q96EB6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
SIRT1Q96EB6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SIRT1Q96EB6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
SIRT1Q96EB6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
SIRT1Q96EB6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
SIRT1Q96EB6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
SIRT1Q96EB6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SIRT1Q96EB6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SIRT1Q96EB6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SIRT1Q96EB6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SIRT1Q96EB6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SIRT1Q96EB6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SIRT1Q96EB6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SIRT1Q96EB6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SIRT1Q96EB6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SIRT1Q96EB6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SIRT1Q96EB6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SIRT1Q96EB6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SIRT1Q96EB6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SIRT1Q96EB6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SIRT1Q96EB6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SIRT1Q96EB6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
SIRT1Q96EB6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SIRT1Q96EB6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SIRT1Q96EB6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SIRT1Q96EB6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SIRT1Q96EB6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
SIRT1Q96EB6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
SIRT1Q96EB6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SIRT1Q96EB6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SIRT1Q96EB6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SIRT1Q96EB6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms