Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CMTM5Q96DZ9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CMTM5Q96DZ9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CMTM5Q96DZ9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CMTM5Q96DZ9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CMTM5Q96DZ9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CMTM5Q96DZ9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CMTM5Q96DZ9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CMTM5Q96DZ9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CMTM5Q96DZ9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CMTM5Q96DZ9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CMTM5Q96DZ9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CMTM5Q96DZ9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CMTM5Q96DZ9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CMTM5Q96DZ9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CMTM5Q96DZ9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CMTM5Q96DZ9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CMTM5Q96DZ9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CMTM5Q96DZ9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CMTM5Q96DZ9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CMTM5Q96DZ9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CMTM5Q96DZ9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CMTM5Q96DZ9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CMTM5Q96DZ9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CMTM5Q96DZ9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CMTM5Q96DZ9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CMTM5Q96DZ9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CMTM5Q96DZ9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CMTM5Q96DZ9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CMTM5Q96DZ9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CMTM5Q96DZ9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CMTM5Q96DZ9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CMTM5Q96DZ9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CMTM5Q96DZ9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CMTM5Q96DZ9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CMTM5Q96DZ9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CMTM5Q96DZ9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CMTM5Q96DZ9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CMTM5Q96DZ9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CMTM5Q96DZ9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CMTM5Q96DZ9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CMTM5Q96DZ9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CMTM5Q96DZ9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CMTM5Q96DZ9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CMTM5Q96DZ9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CMTM5Q96DZ9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CMTM5Q96DZ9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CMTM5Q96DZ9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CMTM5Q96DZ9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CMTM5Q96DZ9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CMTM5Q96DZ9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CMTM5Q96DZ9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CMTM5Q96DZ9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CMTM5Q96DZ9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CMTM5Q96DZ9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CMTM5Q96DZ9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CMTM5Q96DZ9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CMTM5Q96DZ9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CMTM5Q96DZ9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CMTM5Q96DZ9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CMTM5Q96DZ9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CMTM5Q96DZ9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CMTM5Q96DZ9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CMTM5Q96DZ9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CMTM5Q96DZ9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CMTM5Q96DZ9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CMTM5Q96DZ9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CMTM5Q96DZ9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CMTM5Q96DZ9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CMTM5Q96DZ9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CMTM5Q96DZ9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CMTM5Q96DZ9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CMTM5Q96DZ9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CMTM5Q96DZ9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CMTM5Q96DZ9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CMTM5Q96DZ9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CMTM5Q96DZ9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CMTM5Q96DZ9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CMTM5Q96DZ9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CMTM5Q96DZ9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CMTM5Q96DZ9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CMTM5Q96DZ9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CMTM5Q96DZ9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CMTM5Q96DZ9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CMTM5Q96DZ9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CMTM5Q96DZ9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CMTM5Q96DZ9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CMTM5Q96DZ9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CMTM5Q96DZ9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CMTM5Q96DZ9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CMTM5Q96DZ9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMTM5Q96DZ9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMTM5Q96DZ9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMTM5Q96DZ9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMTM5Q96DZ9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMTM5Q96DZ9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMTM5Q96DZ9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMTM5Q96DZ9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMTM5Q96DZ9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMTM5Q96DZ9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms