Protein–RNA interactions for Protein: Q96D71

REPS1, RalBP1-associated Eps domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPS1Q96D71 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
REPS1Q96D71 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
REPS1Q96D71 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
REPS1Q96D71 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
REPS1Q96D71 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
REPS1Q96D71 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
REPS1Q96D71 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
REPS1Q96D71 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
REPS1Q96D71 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
REPS1Q96D71 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
REPS1Q96D71 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
REPS1Q96D71 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
REPS1Q96D71 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
REPS1Q96D71 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
REPS1Q96D71 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
REPS1Q96D71 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
REPS1Q96D71 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
REPS1Q96D71 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
REPS1Q96D71 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
REPS1Q96D71 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
REPS1Q96D71 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
REPS1Q96D71 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
REPS1Q96D71 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
REPS1Q96D71 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
REPS1Q96D71 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
REPS1Q96D71 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
REPS1Q96D71 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
REPS1Q96D71 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
REPS1Q96D71 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
REPS1Q96D71 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
REPS1Q96D71 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
REPS1Q96D71 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
REPS1Q96D71 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
REPS1Q96D71 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
REPS1Q96D71 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
REPS1Q96D71 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
REPS1Q96D71 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
REPS1Q96D71 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
REPS1Q96D71 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
REPS1Q96D71 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
REPS1Q96D71 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
REPS1Q96D71 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
REPS1Q96D71 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
REPS1Q96D71 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
REPS1Q96D71 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
REPS1Q96D71 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
REPS1Q96D71 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
REPS1Q96D71 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
REPS1Q96D71 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
REPS1Q96D71 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
REPS1Q96D71 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
REPS1Q96D71 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
REPS1Q96D71 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
REPS1Q96D71 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
REPS1Q96D71 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
REPS1Q96D71 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
REPS1Q96D71 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
REPS1Q96D71 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
REPS1Q96D71 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
REPS1Q96D71 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
REPS1Q96D71 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
REPS1Q96D71 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
REPS1Q96D71 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
REPS1Q96D71 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
REPS1Q96D71 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
REPS1Q96D71 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
REPS1Q96D71 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
REPS1Q96D71 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
REPS1Q96D71 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
REPS1Q96D71 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
REPS1Q96D71 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
REPS1Q96D71 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
REPS1Q96D71 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
REPS1Q96D71 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
REPS1Q96D71 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
REPS1Q96D71 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
REPS1Q96D71 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
REPS1Q96D71 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
REPS1Q96D71 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
REPS1Q96D71 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
REPS1Q96D71 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
REPS1Q96D71 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
REPS1Q96D71 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
REPS1Q96D71 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
REPS1Q96D71 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
REPS1Q96D71 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
REPS1Q96D71 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
REPS1Q96D71 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
REPS1Q96D71 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
REPS1Q96D71 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
REPS1Q96D71 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
REPS1Q96D71 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
REPS1Q96D71 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
REPS1Q96D71 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
REPS1Q96D71 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
REPS1Q96D71 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
REPS1Q96D71 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
REPS1Q96D71 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
REPS1Q96D71 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
REPS1Q96D71 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms