Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NMD3Q96D46 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NMD3Q96D46 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NMD3Q96D46 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NMD3Q96D46 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NMD3Q96D46 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NMD3Q96D46 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NMD3Q96D46 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NMD3Q96D46 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NMD3Q96D46 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NMD3Q96D46 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NMD3Q96D46 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NMD3Q96D46 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NMD3Q96D46 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NMD3Q96D46 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NMD3Q96D46 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NMD3Q96D46 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NMD3Q96D46 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NMD3Q96D46 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NMD3Q96D46 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NMD3Q96D46 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NMD3Q96D46 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NMD3Q96D46 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NMD3Q96D46 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NMD3Q96D46 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NMD3Q96D46 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NMD3Q96D46 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NMD3Q96D46 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NMD3Q96D46 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NMD3Q96D46 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NMD3Q96D46 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NMD3Q96D46 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NMD3Q96D46 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NMD3Q96D46 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NMD3Q96D46 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NMD3Q96D46 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NMD3Q96D46 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NMD3Q96D46 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NMD3Q96D46 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NMD3Q96D46 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NMD3Q96D46 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NMD3Q96D46 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NMD3Q96D46 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NMD3Q96D46 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NMD3Q96D46 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NMD3Q96D46 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NMD3Q96D46 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NMD3Q96D46 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NMD3Q96D46 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NMD3Q96D46 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NMD3Q96D46 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NMD3Q96D46 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NMD3Q96D46 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NMD3Q96D46 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NMD3Q96D46 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NMD3Q96D46 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NMD3Q96D46 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NMD3Q96D46 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NMD3Q96D46 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NMD3Q96D46 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NMD3Q96D46 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NMD3Q96D46 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NMD3Q96D46 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NMD3Q96D46 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NMD3Q96D46 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NMD3Q96D46 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NMD3Q96D46 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NMD3Q96D46 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NMD3Q96D46 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NMD3Q96D46 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NMD3Q96D46 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NMD3Q96D46 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NMD3Q96D46 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NMD3Q96D46 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NMD3Q96D46 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NMD3Q96D46 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NMD3Q96D46 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NMD3Q96D46 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NMD3Q96D46 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NMD3Q96D46 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NMD3Q96D46 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NMD3Q96D46 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NMD3Q96D46 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NMD3Q96D46 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NMD3Q96D46 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NMD3Q96D46 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NMD3Q96D46 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NMD3Q96D46 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NMD3Q96D46 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NMD3Q96D46 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NMD3Q96D46 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NMD3Q96D46 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NMD3Q96D46 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NMD3Q96D46 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NMD3Q96D46 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NMD3Q96D46 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NMD3Q96D46 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NMD3Q96D46 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NMD3Q96D46 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NMD3Q96D46 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.7 ms