Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
EAF2Q96CJ1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
EAF2Q96CJ1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
EAF2Q96CJ1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
EAF2Q96CJ1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
EAF2Q96CJ1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
EAF2Q96CJ1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
EAF2Q96CJ1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
EAF2Q96CJ1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
EAF2Q96CJ1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
EAF2Q96CJ1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
EAF2Q96CJ1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
EAF2Q96CJ1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
EAF2Q96CJ1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
EAF2Q96CJ1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
EAF2Q96CJ1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
EAF2Q96CJ1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
EAF2Q96CJ1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
EAF2Q96CJ1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
EAF2Q96CJ1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
EAF2Q96CJ1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
EAF2Q96CJ1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
EAF2Q96CJ1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
EAF2Q96CJ1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
EAF2Q96CJ1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
EAF2Q96CJ1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
EAF2Q96CJ1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
EAF2Q96CJ1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
EAF2Q96CJ1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
EAF2Q96CJ1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
EAF2Q96CJ1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
EAF2Q96CJ1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
EAF2Q96CJ1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
EAF2Q96CJ1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
EAF2Q96CJ1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
EAF2Q96CJ1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
EAF2Q96CJ1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
EAF2Q96CJ1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
EAF2Q96CJ1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
EAF2Q96CJ1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
EAF2Q96CJ1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
EAF2Q96CJ1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
EAF2Q96CJ1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
EAF2Q96CJ1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
EAF2Q96CJ1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
EAF2Q96CJ1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
EAF2Q96CJ1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
EAF2Q96CJ1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
EAF2Q96CJ1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
EAF2Q96CJ1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
EAF2Q96CJ1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
EAF2Q96CJ1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.9■■■□□ 2.54
EAF2Q96CJ1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
EAF2Q96CJ1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
EAF2Q96CJ1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
EAF2Q96CJ1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
EAF2Q96CJ1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
EAF2Q96CJ1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
EAF2Q96CJ1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
EAF2Q96CJ1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
EAF2Q96CJ1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
EAF2Q96CJ1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
EAF2Q96CJ1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
EAF2Q96CJ1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
EAF2Q96CJ1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
EAF2Q96CJ1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
EAF2Q96CJ1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
EAF2Q96CJ1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
EAF2Q96CJ1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
EAF2Q96CJ1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
EAF2Q96CJ1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
EAF2Q96CJ1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
EAF2Q96CJ1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
EAF2Q96CJ1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
EAF2Q96CJ1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
EAF2Q96CJ1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
EAF2Q96CJ1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
EAF2Q96CJ1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
EAF2Q96CJ1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
EAF2Q96CJ1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
EAF2Q96CJ1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
EAF2Q96CJ1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
EAF2Q96CJ1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
EAF2Q96CJ1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
EAF2Q96CJ1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
EAF2Q96CJ1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
EAF2Q96CJ1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
EAF2Q96CJ1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
EAF2Q96CJ1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
EAF2Q96CJ1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
EAF2Q96CJ1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
EAF2Q96CJ1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
EAF2Q96CJ1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
EAF2Q96CJ1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
EAF2Q96CJ1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
EAF2Q96CJ1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
EAF2Q96CJ1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
EAF2Q96CJ1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
EAF2Q96CJ1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
EAF2Q96CJ1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms