Protein–RNA interactions for Protein: Q96CC6

RHBDF1, Inactive rhomboid protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF1Q96CC6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDF1Q96CC6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDF1Q96CC6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDF1Q96CC6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDF1Q96CC6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDF1Q96CC6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDF1Q96CC6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDF1Q96CC6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDF1Q96CC6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDF1Q96CC6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDF1Q96CC6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDF1Q96CC6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDF1Q96CC6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDF1Q96CC6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDF1Q96CC6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDF1Q96CC6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDF1Q96CC6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDF1Q96CC6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDF1Q96CC6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDF1Q96CC6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDF1Q96CC6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDF1Q96CC6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHBDF1Q96CC6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHBDF1Q96CC6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHBDF1Q96CC6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDF1Q96CC6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDF1Q96CC6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDF1Q96CC6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDF1Q96CC6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDF1Q96CC6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDF1Q96CC6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDF1Q96CC6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDF1Q96CC6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDF1Q96CC6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDF1Q96CC6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDF1Q96CC6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RHBDF1Q96CC6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHBDF1Q96CC6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHBDF1Q96CC6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHBDF1Q96CC6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHBDF1Q96CC6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDF1Q96CC6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDF1Q96CC6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDF1Q96CC6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDF1Q96CC6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDF1Q96CC6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDF1Q96CC6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDF1Q96CC6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHBDF1Q96CC6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHBDF1Q96CC6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHBDF1Q96CC6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDF1Q96CC6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDF1Q96CC6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDF1Q96CC6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RHBDF1Q96CC6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHBDF1Q96CC6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHBDF1Q96CC6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDF1Q96CC6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDF1Q96CC6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDF1Q96CC6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDF1Q96CC6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDF1Q96CC6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDF1Q96CC6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDF1Q96CC6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDF1Q96CC6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDF1Q96CC6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDF1Q96CC6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDF1Q96CC6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDF1Q96CC6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDF1Q96CC6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDF1Q96CC6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDF1Q96CC6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHBDF1Q96CC6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RHBDF1Q96CC6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RHBDF1Q96CC6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RHBDF1Q96CC6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDF1Q96CC6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDF1Q96CC6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDF1Q96CC6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDF1Q96CC6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDF1Q96CC6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHBDF1Q96CC6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHBDF1Q96CC6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHBDF1Q96CC6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHBDF1Q96CC6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHBDF1Q96CC6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHBDF1Q96CC6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHBDF1Q96CC6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHBDF1Q96CC6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHBDF1Q96CC6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHBDF1Q96CC6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDF1Q96CC6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDF1Q96CC6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDF1Q96CC6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDF1Q96CC6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHBDF1Q96CC6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHBDF1Q96CC6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RHBDF1Q96CC6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RHBDF1Q96CC6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RHBDF1Q96CC6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms