Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC127Q96BQ5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC127Q96BQ5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC127Q96BQ5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC127Q96BQ5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC127Q96BQ5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC127Q96BQ5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC127Q96BQ5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC127Q96BQ5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC127Q96BQ5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC127Q96BQ5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC127Q96BQ5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC127Q96BQ5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC127Q96BQ5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC127Q96BQ5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC127Q96BQ5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC127Q96BQ5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC127Q96BQ5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC127Q96BQ5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC127Q96BQ5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC127Q96BQ5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC127Q96BQ5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC127Q96BQ5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC127Q96BQ5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC127Q96BQ5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC127Q96BQ5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC127Q96BQ5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC127Q96BQ5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC127Q96BQ5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC127Q96BQ5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC127Q96BQ5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC127Q96BQ5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC127Q96BQ5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC127Q96BQ5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC127Q96BQ5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC127Q96BQ5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC127Q96BQ5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC127Q96BQ5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC127Q96BQ5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC127Q96BQ5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC127Q96BQ5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC127Q96BQ5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC127Q96BQ5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC127Q96BQ5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC127Q96BQ5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC127Q96BQ5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC127Q96BQ5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC127Q96BQ5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC127Q96BQ5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC127Q96BQ5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC127Q96BQ5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC127Q96BQ5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC127Q96BQ5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC127Q96BQ5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC127Q96BQ5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC127Q96BQ5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC127Q96BQ5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC127Q96BQ5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC127Q96BQ5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC127Q96BQ5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC127Q96BQ5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC127Q96BQ5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC127Q96BQ5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC127Q96BQ5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC127Q96BQ5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC127Q96BQ5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC127Q96BQ5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC127Q96BQ5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC127Q96BQ5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC127Q96BQ5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC127Q96BQ5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC127Q96BQ5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC127Q96BQ5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC127Q96BQ5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC127Q96BQ5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC127Q96BQ5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC127Q96BQ5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC127Q96BQ5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC127Q96BQ5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC127Q96BQ5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC127Q96BQ5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC127Q96BQ5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC127Q96BQ5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC127Q96BQ5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC127Q96BQ5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC127Q96BQ5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC127Q96BQ5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC127Q96BQ5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC127Q96BQ5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC127Q96BQ5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC127Q96BQ5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC127Q96BQ5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC127Q96BQ5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC127Q96BQ5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC127Q96BQ5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC127Q96BQ5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC127Q96BQ5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC127Q96BQ5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC127Q96BQ5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC127Q96BQ5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms