Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms