Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
VTI1AQ96AJ9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VTI1AQ96AJ9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms