Protein–RNA interactions for Protein: Q969X5

ERGIC1, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC1Q969X5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERGIC1Q969X5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERGIC1Q969X5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERGIC1Q969X5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERGIC1Q969X5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ERGIC1Q969X5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ERGIC1Q969X5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERGIC1Q969X5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERGIC1Q969X5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERGIC1Q969X5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERGIC1Q969X5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ERGIC1Q969X5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ERGIC1Q969X5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERGIC1Q969X5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERGIC1Q969X5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERGIC1Q969X5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ERGIC1Q969X5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERGIC1Q969X5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERGIC1Q969X5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERGIC1Q969X5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERGIC1Q969X5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERGIC1Q969X5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERGIC1Q969X5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERGIC1Q969X5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERGIC1Q969X5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERGIC1Q969X5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERGIC1Q969X5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERGIC1Q969X5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERGIC1Q969X5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ERGIC1Q969X5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERGIC1Q969X5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERGIC1Q969X5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERGIC1Q969X5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERGIC1Q969X5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ERGIC1Q969X5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERGIC1Q969X5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERGIC1Q969X5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ERGIC1Q969X5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERGIC1Q969X5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ERGIC1Q969X5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERGIC1Q969X5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERGIC1Q969X5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERGIC1Q969X5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERGIC1Q969X5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERGIC1Q969X5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERGIC1Q969X5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERGIC1Q969X5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERGIC1Q969X5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERGIC1Q969X5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERGIC1Q969X5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERGIC1Q969X5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERGIC1Q969X5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERGIC1Q969X5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERGIC1Q969X5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERGIC1Q969X5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERGIC1Q969X5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERGIC1Q969X5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERGIC1Q969X5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERGIC1Q969X5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ERGIC1Q969X5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERGIC1Q969X5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERGIC1Q969X5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERGIC1Q969X5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERGIC1Q969X5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERGIC1Q969X5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERGIC1Q969X5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERGIC1Q969X5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERGIC1Q969X5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERGIC1Q969X5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERGIC1Q969X5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERGIC1Q969X5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERGIC1Q969X5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERGIC1Q969X5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERGIC1Q969X5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ERGIC1Q969X5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERGIC1Q969X5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERGIC1Q969X5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERGIC1Q969X5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERGIC1Q969X5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERGIC1Q969X5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERGIC1Q969X5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERGIC1Q969X5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERGIC1Q969X5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERGIC1Q969X5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERGIC1Q969X5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERGIC1Q969X5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERGIC1Q969X5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERGIC1Q969X5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERGIC1Q969X5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERGIC1Q969X5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERGIC1Q969X5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERGIC1Q969X5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERGIC1Q969X5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERGIC1Q969X5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERGIC1Q969X5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERGIC1Q969X5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERGIC1Q969X5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERGIC1Q969X5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERGIC1Q969X5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERGIC1Q969X5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.4 ms