Protein–RNA interactions for Protein: Q92890

UFD1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFD1Q92890 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFD1Q92890 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFD1Q92890 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFD1Q92890 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFD1Q92890 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFD1Q92890 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFD1Q92890 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UFD1Q92890 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UFD1Q92890 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UFD1Q92890 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UFD1Q92890 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UFD1Q92890 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UFD1Q92890 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFD1Q92890 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFD1Q92890 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFD1Q92890 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFD1Q92890 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFD1Q92890 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFD1Q92890 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFD1Q92890 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFD1Q92890 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFD1Q92890 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFD1Q92890 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFD1Q92890 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UFD1Q92890 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFD1Q92890 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UFD1Q92890 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UFD1Q92890 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UFD1Q92890 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UFD1Q92890 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UFD1Q92890 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UFD1Q92890 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UFD1Q92890 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UFD1Q92890 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UFD1Q92890 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UFD1Q92890 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UFD1Q92890 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UFD1Q92890 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UFD1Q92890 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UFD1Q92890 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UFD1Q92890 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UFD1Q92890 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UFD1Q92890 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UFD1Q92890 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UFD1Q92890 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UFD1Q92890 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UFD1Q92890 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UFD1Q92890 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UFD1Q92890 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UFD1Q92890 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UFD1Q92890 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UFD1Q92890 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UFD1Q92890 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UFD1Q92890 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UFD1Q92890 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UFD1Q92890 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UFD1Q92890 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UFD1Q92890 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UFD1Q92890 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UFD1Q92890 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UFD1Q92890 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UFD1Q92890 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UFD1Q92890 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UFD1Q92890 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UFD1Q92890 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UFD1Q92890 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UFD1Q92890 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UFD1Q92890 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UFD1Q92890 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UFD1Q92890 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UFD1Q92890 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UFD1Q92890 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UFD1Q92890 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UFD1Q92890 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UFD1Q92890 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UFD1Q92890 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UFD1Q92890 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UFD1Q92890 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UFD1Q92890 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UFD1Q92890 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UFD1Q92890 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UFD1Q92890 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UFD1Q92890 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UFD1Q92890 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UFD1Q92890 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UFD1Q92890 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UFD1Q92890 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UFD1Q92890 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UFD1Q92890 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UFD1Q92890 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UFD1Q92890 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UFD1Q92890 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UFD1Q92890 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UFD1Q92890 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UFD1Q92890 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UFD1Q92890 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFD1Q92890 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFD1Q92890 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFD1Q92890 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFD1Q92890 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms