Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
TNRQ92752 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
TNRQ92752 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
TNRQ92752 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
TNRQ92752 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
TNRQ92752 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
TNRQ92752 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
TNRQ92752 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
TNRQ92752 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
TNRQ92752 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
TNRQ92752 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
TNRQ92752 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
TNRQ92752 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
TNRQ92752 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC37.15■■■■□ 3.54
TNRQ92752 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
TNRQ92752 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
TNRQ92752 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
TNRQ92752 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
TNRQ92752 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
TNRQ92752 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
TNRQ92752 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
TNRQ92752 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
TNRQ92752 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TNRQ92752 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
TNRQ92752 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
TNRQ92752 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
TNRQ92752 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
TNRQ92752 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TNRQ92752 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
TNRQ92752 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
TNRQ92752 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
TNRQ92752 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
TNRQ92752 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
TNRQ92752 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
TNRQ92752 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
TNRQ92752 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
TNRQ92752 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
TNRQ92752 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
TNRQ92752 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
TNRQ92752 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
TNRQ92752 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
TNRQ92752 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
TNRQ92752 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
TNRQ92752 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC37.04■■■■□ 3.52
TNRQ92752 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
TNRQ92752 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
TNRQ92752 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
TNRQ92752 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
TNRQ92752 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
TNRQ92752 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.03■■■■□ 3.52
TNRQ92752 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
TNRQ92752 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
TNRQ92752 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
TNRQ92752 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
TNRQ92752 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
TNRQ92752 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
TNRQ92752 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC37■■■■□ 3.51
TNRQ92752 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
TNRQ92752 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
TNRQ92752 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
TNRQ92752 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
TNRQ92752 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TNRQ92752 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
TNRQ92752 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TNRQ92752 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TNRQ92752 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TNRQ92752 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TNRQ92752 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
TNRQ92752 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
TNRQ92752 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
TNRQ92752 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
TNRQ92752 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
TNRQ92752 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
TNRQ92752 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
TNRQ92752 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
TNRQ92752 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
TNRQ92752 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
TNRQ92752 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
TNRQ92752 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
TNRQ92752 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
TNRQ92752 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
TNRQ92752 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
TNRQ92752 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TNRQ92752 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TNRQ92752 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
TNRQ92752 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
TNRQ92752 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
TNRQ92752 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
TNRQ92752 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
TNRQ92752 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
TNRQ92752 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
TNRQ92752 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
TNRQ92752 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
TNRQ92752 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
TNRQ92752 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
TNRQ92752 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
TNRQ92752 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
TNRQ92752 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
TNRQ92752 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
TNRQ92752 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms