Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HTRA1Q92743 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTRA1Q92743 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTRA1Q92743 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTRA1Q92743 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTRA1Q92743 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTRA1Q92743 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTRA1Q92743 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTRA1Q92743 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTRA1Q92743 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTRA1Q92743 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTRA1Q92743 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTRA1Q92743 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTRA1Q92743 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTRA1Q92743 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTRA1Q92743 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HTRA1Q92743 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTRA1Q92743 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTRA1Q92743 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTRA1Q92743 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTRA1Q92743 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTRA1Q92743 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTRA1Q92743 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTRA1Q92743 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTRA1Q92743 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTRA1Q92743 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTRA1Q92743 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTRA1Q92743 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTRA1Q92743 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTRA1Q92743 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTRA1Q92743 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTRA1Q92743 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTRA1Q92743 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HTRA1Q92743 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTRA1Q92743 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTRA1Q92743 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTRA1Q92743 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTRA1Q92743 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTRA1Q92743 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTRA1Q92743 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTRA1Q92743 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTRA1Q92743 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTRA1Q92743 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTRA1Q92743 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTRA1Q92743 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTRA1Q92743 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTRA1Q92743 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTRA1Q92743 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTRA1Q92743 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTRA1Q92743 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTRA1Q92743 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTRA1Q92743 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTRA1Q92743 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTRA1Q92743 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTRA1Q92743 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTRA1Q92743 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTRA1Q92743 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTRA1Q92743 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTRA1Q92743 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTRA1Q92743 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTRA1Q92743 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTRA1Q92743 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTRA1Q92743 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTRA1Q92743 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTRA1Q92743 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HTRA1Q92743 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTRA1Q92743 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTRA1Q92743 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTRA1Q92743 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HTRA1Q92743 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTRA1Q92743 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTRA1Q92743 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTRA1Q92743 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTRA1Q92743 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTRA1Q92743 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTRA1Q92743 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTRA1Q92743 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTRA1Q92743 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTRA1Q92743 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTRA1Q92743 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTRA1Q92743 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HTRA1Q92743 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTRA1Q92743 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTRA1Q92743 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTRA1Q92743 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTRA1Q92743 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTRA1Q92743 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTRA1Q92743 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTRA1Q92743 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTRA1Q92743 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTRA1Q92743 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HTRA1Q92743 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA1Q92743 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA1Q92743 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA1Q92743 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA1Q92743 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA1Q92743 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA1Q92743 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA1Q92743 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTRA1Q92743 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms