Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM9SF4Q92544 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TM9SF4Q92544 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TM9SF4Q92544 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TM9SF4Q92544 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM9SF4Q92544 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TM9SF4Q92544 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TM9SF4Q92544 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TM9SF4Q92544 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TM9SF4Q92544 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TM9SF4Q92544 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TM9SF4Q92544 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TM9SF4Q92544 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TM9SF4Q92544 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM9SF4Q92544 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM9SF4Q92544 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM9SF4Q92544 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM9SF4Q92544 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM9SF4Q92544 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM9SF4Q92544 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM9SF4Q92544 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM9SF4Q92544 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM9SF4Q92544 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TM9SF4Q92544 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM9SF4Q92544 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM9SF4Q92544 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM9SF4Q92544 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM9SF4Q92544 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM9SF4Q92544 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM9SF4Q92544 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM9SF4Q92544 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM9SF4Q92544 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM9SF4Q92544 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TM9SF4Q92544 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TM9SF4Q92544 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM9SF4Q92544 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM9SF4Q92544 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM9SF4Q92544 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM9SF4Q92544 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM9SF4Q92544 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM9SF4Q92544 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM9SF4Q92544 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM9SF4Q92544 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM9SF4Q92544 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TM9SF4Q92544 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM9SF4Q92544 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM9SF4Q92544 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM9SF4Q92544 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM9SF4Q92544 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM9SF4Q92544 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM9SF4Q92544 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM9SF4Q92544 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TM9SF4Q92544 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM9SF4Q92544 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM9SF4Q92544 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM9SF4Q92544 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM9SF4Q92544 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM9SF4Q92544 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM9SF4Q92544 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM9SF4Q92544 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM9SF4Q92544 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM9SF4Q92544 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM9SF4Q92544 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM9SF4Q92544 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TM9SF4Q92544 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM9SF4Q92544 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM9SF4Q92544 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM9SF4Q92544 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM9SF4Q92544 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM9SF4Q92544 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM9SF4Q92544 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM9SF4Q92544 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM9SF4Q92544 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TM9SF4Q92544 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM9SF4Q92544 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM9SF4Q92544 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM9SF4Q92544 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM9SF4Q92544 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM9SF4Q92544 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TM9SF4Q92544 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TM9SF4Q92544 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TM9SF4Q92544 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TM9SF4Q92544 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TM9SF4Q92544 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM9SF4Q92544 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM9SF4Q92544 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM9SF4Q92544 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TM9SF4Q92544 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM9SF4Q92544 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM9SF4Q92544 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM9SF4Q92544 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM9SF4Q92544 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TM9SF4Q92544 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM9SF4Q92544 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM9SF4Q92544 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM9SF4Q92544 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM9SF4Q92544 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM9SF4Q92544 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TM9SF4Q92544 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM9SF4Q92544 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms