Protein–RNA interactions for Protein: Q92543

SNX19, Sorting nexin-19, humanhuman

Predictions only

Length 992 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX19Q92543 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX19Q92543 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX19Q92543 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX19Q92543 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX19Q92543 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX19Q92543 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX19Q92543 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX19Q92543 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX19Q92543 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX19Q92543 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX19Q92543 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX19Q92543 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX19Q92543 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX19Q92543 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX19Q92543 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX19Q92543 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX19Q92543 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX19Q92543 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX19Q92543 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX19Q92543 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX19Q92543 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX19Q92543 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX19Q92543 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX19Q92543 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX19Q92543 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX19Q92543 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX19Q92543 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX19Q92543 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX19Q92543 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX19Q92543 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX19Q92543 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SNX19Q92543 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX19Q92543 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX19Q92543 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX19Q92543 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX19Q92543 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX19Q92543 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX19Q92543 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX19Q92543 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX19Q92543 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX19Q92543 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX19Q92543 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX19Q92543 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX19Q92543 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX19Q92543 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX19Q92543 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX19Q92543 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX19Q92543 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX19Q92543 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX19Q92543 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX19Q92543 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX19Q92543 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX19Q92543 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX19Q92543 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX19Q92543 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX19Q92543 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX19Q92543 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX19Q92543 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX19Q92543 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX19Q92543 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX19Q92543 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX19Q92543 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX19Q92543 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX19Q92543 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX19Q92543 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX19Q92543 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX19Q92543 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX19Q92543 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX19Q92543 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX19Q92543 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX19Q92543 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX19Q92543 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX19Q92543 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX19Q92543 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX19Q92543 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX19Q92543 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX19Q92543 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX19Q92543 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX19Q92543 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX19Q92543 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX19Q92543 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX19Q92543 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX19Q92543 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX19Q92543 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX19Q92543 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX19Q92543 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX19Q92543 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SNX19Q92543 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX19Q92543 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX19Q92543 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX19Q92543 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX19Q92543 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX19Q92543 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX19Q92543 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX19Q92543 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX19Q92543 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX19Q92543 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX19Q92543 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX19Q92543 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX19Q92543 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms