Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCG3Q8WXD2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCG3Q8WXD2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCG3Q8WXD2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCG3Q8WXD2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCG3Q8WXD2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCG3Q8WXD2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SCG3Q8WXD2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCG3Q8WXD2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCG3Q8WXD2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCG3Q8WXD2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCG3Q8WXD2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCG3Q8WXD2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCG3Q8WXD2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCG3Q8WXD2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCG3Q8WXD2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCG3Q8WXD2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCG3Q8WXD2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCG3Q8WXD2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SCG3Q8WXD2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCG3Q8WXD2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCG3Q8WXD2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCG3Q8WXD2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCG3Q8WXD2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCG3Q8WXD2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCG3Q8WXD2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCG3Q8WXD2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCG3Q8WXD2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCG3Q8WXD2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCG3Q8WXD2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCG3Q8WXD2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCG3Q8WXD2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCG3Q8WXD2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCG3Q8WXD2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCG3Q8WXD2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCG3Q8WXD2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCG3Q8WXD2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCG3Q8WXD2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCG3Q8WXD2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCG3Q8WXD2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCG3Q8WXD2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCG3Q8WXD2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCG3Q8WXD2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCG3Q8WXD2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCG3Q8WXD2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCG3Q8WXD2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCG3Q8WXD2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCG3Q8WXD2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCG3Q8WXD2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCG3Q8WXD2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCG3Q8WXD2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCG3Q8WXD2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCG3Q8WXD2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SCG3Q8WXD2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCG3Q8WXD2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCG3Q8WXD2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCG3Q8WXD2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCG3Q8WXD2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCG3Q8WXD2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCG3Q8WXD2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SCG3Q8WXD2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCG3Q8WXD2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCG3Q8WXD2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCG3Q8WXD2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCG3Q8WXD2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCG3Q8WXD2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCG3Q8WXD2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCG3Q8WXD2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCG3Q8WXD2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCG3Q8WXD2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCG3Q8WXD2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCG3Q8WXD2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCG3Q8WXD2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SCG3Q8WXD2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCG3Q8WXD2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCG3Q8WXD2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCG3Q8WXD2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCG3Q8WXD2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCG3Q8WXD2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCG3Q8WXD2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCG3Q8WXD2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCG3Q8WXD2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCG3Q8WXD2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCG3Q8WXD2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCG3Q8WXD2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCG3Q8WXD2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCG3Q8WXD2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCG3Q8WXD2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SCG3Q8WXD2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCG3Q8WXD2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCG3Q8WXD2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCG3Q8WXD2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCG3Q8WXD2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCG3Q8WXD2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCG3Q8WXD2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCG3Q8WXD2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SCG3Q8WXD2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SCG3Q8WXD2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SCG3Q8WXD2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCG3Q8WXD2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.2 ms