Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVD3

RNF138, E3 ubiquitin-protein ligase RNF138, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF138Q8WVD3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF138Q8WVD3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF138Q8WVD3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF138Q8WVD3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF138Q8WVD3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF138Q8WVD3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF138Q8WVD3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF138Q8WVD3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF138Q8WVD3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF138Q8WVD3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF138Q8WVD3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF138Q8WVD3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF138Q8WVD3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF138Q8WVD3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF138Q8WVD3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF138Q8WVD3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF138Q8WVD3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF138Q8WVD3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF138Q8WVD3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF138Q8WVD3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF138Q8WVD3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF138Q8WVD3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF138Q8WVD3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF138Q8WVD3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF138Q8WVD3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF138Q8WVD3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF138Q8WVD3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF138Q8WVD3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF138Q8WVD3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF138Q8WVD3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF138Q8WVD3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF138Q8WVD3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF138Q8WVD3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF138Q8WVD3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF138Q8WVD3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF138Q8WVD3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RNF138Q8WVD3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF138Q8WVD3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF138Q8WVD3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF138Q8WVD3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF138Q8WVD3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF138Q8WVD3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF138Q8WVD3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF138Q8WVD3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF138Q8WVD3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF138Q8WVD3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF138Q8WVD3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF138Q8WVD3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF138Q8WVD3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF138Q8WVD3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF138Q8WVD3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF138Q8WVD3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF138Q8WVD3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF138Q8WVD3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF138Q8WVD3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF138Q8WVD3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF138Q8WVD3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF138Q8WVD3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF138Q8WVD3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 438.2 ms