Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF30

WHAMM, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMQ8TF30 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
WHAMMQ8TF30 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
WHAMMQ8TF30 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
WHAMMQ8TF30 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
WHAMMQ8TF30 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
WHAMMQ8TF30 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
WHAMMQ8TF30 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
WHAMMQ8TF30 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
WHAMMQ8TF30 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
WHAMMQ8TF30 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
WHAMMQ8TF30 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
WHAMMQ8TF30 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
WHAMMQ8TF30 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
WHAMMQ8TF30 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
WHAMMQ8TF30 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
WHAMMQ8TF30 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
WHAMMQ8TF30 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
WHAMMQ8TF30 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
WHAMMQ8TF30 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
WHAMMQ8TF30 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
WHAMMQ8TF30 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
WHAMMQ8TF30 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
WHAMMQ8TF30 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
WHAMMQ8TF30 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
WHAMMQ8TF30 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
WHAMMQ8TF30 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
WHAMMQ8TF30 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
WHAMMQ8TF30 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
WHAMMQ8TF30 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
WHAMMQ8TF30 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
WHAMMQ8TF30 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
WHAMMQ8TF30 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
WHAMMQ8TF30 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
WHAMMQ8TF30 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
WHAMMQ8TF30 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
WHAMMQ8TF30 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
WHAMMQ8TF30 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
WHAMMQ8TF30 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
WHAMMQ8TF30 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
WHAMMQ8TF30 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
WHAMMQ8TF30 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
WHAMMQ8TF30 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
WHAMMQ8TF30 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
WHAMMQ8TF30 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
WHAMMQ8TF30 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
WHAMMQ8TF30 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
WHAMMQ8TF30 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
WHAMMQ8TF30 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
WHAMMQ8TF30 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
WHAMMQ8TF30 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
WHAMMQ8TF30 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
WHAMMQ8TF30 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
WHAMMQ8TF30 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
WHAMMQ8TF30 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
WHAMMQ8TF30 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
WHAMMQ8TF30 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
WHAMMQ8TF30 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
WHAMMQ8TF30 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
WHAMMQ8TF30 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
WHAMMQ8TF30 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
WHAMMQ8TF30 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
WHAMMQ8TF30 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
WHAMMQ8TF30 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
WHAMMQ8TF30 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
WHAMMQ8TF30 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
WHAMMQ8TF30 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
WHAMMQ8TF30 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
WHAMMQ8TF30 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
WHAMMQ8TF30 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
WHAMMQ8TF30 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
WHAMMQ8TF30 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
WHAMMQ8TF30 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
WHAMMQ8TF30 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
WHAMMQ8TF30 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
WHAMMQ8TF30 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
WHAMMQ8TF30 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
WHAMMQ8TF30 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
WHAMMQ8TF30 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
WHAMMQ8TF30 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
WHAMMQ8TF30 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
WHAMMQ8TF30 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
WHAMMQ8TF30 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
WHAMMQ8TF30 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
WHAMMQ8TF30 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
WHAMMQ8TF30 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
WHAMMQ8TF30 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
WHAMMQ8TF30 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
WHAMMQ8TF30 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
WHAMMQ8TF30 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
WHAMMQ8TF30 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
WHAMMQ8TF30 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
WHAMMQ8TF30 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
WHAMMQ8TF30 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
WHAMMQ8TF30 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
WHAMMQ8TF30 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
WHAMMQ8TF30 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
WHAMMQ8TF30 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
WHAMMQ8TF30 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
WHAMMQ8TF30 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
WHAMMQ8TF30 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms