Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA6DQ8NFY4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA6DQ8NFY4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA6DQ8NFY4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA6DQ8NFY4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEMA6DQ8NFY4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEMA6DQ8NFY4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA6DQ8NFY4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA6DQ8NFY4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA6DQ8NFY4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA6DQ8NFY4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA6DQ8NFY4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA6DQ8NFY4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA6DQ8NFY4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA6DQ8NFY4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA6DQ8NFY4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA6DQ8NFY4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA6DQ8NFY4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA6DQ8NFY4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA6DQ8NFY4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA6DQ8NFY4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA6DQ8NFY4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA6DQ8NFY4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA6DQ8NFY4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA6DQ8NFY4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA6DQ8NFY4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA6DQ8NFY4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA6DQ8NFY4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA6DQ8NFY4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA6DQ8NFY4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA6DQ8NFY4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA6DQ8NFY4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA6DQ8NFY4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA6DQ8NFY4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA6DQ8NFY4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA6DQ8NFY4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA6DQ8NFY4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA6DQ8NFY4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA6DQ8NFY4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA6DQ8NFY4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA6DQ8NFY4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA6DQ8NFY4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA6DQ8NFY4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA6DQ8NFY4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA6DQ8NFY4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA6DQ8NFY4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA6DQ8NFY4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA6DQ8NFY4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA6DQ8NFY4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA6DQ8NFY4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA6DQ8NFY4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA6DQ8NFY4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA6DQ8NFY4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA6DQ8NFY4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA6DQ8NFY4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA6DQ8NFY4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA6DQ8NFY4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA6DQ8NFY4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA6DQ8NFY4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA6DQ8NFY4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA6DQ8NFY4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA6DQ8NFY4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA6DQ8NFY4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA6DQ8NFY4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA6DQ8NFY4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA6DQ8NFY4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA6DQ8NFY4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA6DQ8NFY4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA6DQ8NFY4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA6DQ8NFY4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA6DQ8NFY4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA6DQ8NFY4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA6DQ8NFY4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA6DQ8NFY4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA6DQ8NFY4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA6DQ8NFY4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA6DQ8NFY4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA6DQ8NFY4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA6DQ8NFY4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA6DQ8NFY4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA6DQ8NFY4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA6DQ8NFY4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA6DQ8NFY4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA6DQ8NFY4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA6DQ8NFY4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA6DQ8NFY4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA6DQ8NFY4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA6DQ8NFY4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA6DQ8NFY4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA6DQ8NFY4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA6DQ8NFY4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA6DQ8NFY4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA6DQ8NFY4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA6DQ8NFY4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA6DQ8NFY4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA6DQ8NFY4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA6DQ8NFY4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA6DQ8NFY4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA6DQ8NFY4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA6DQ8NFY4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms