Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBK3

SUMF1, Sulfatase-modifying factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMF1Q8NBK3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUMF1Q8NBK3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUMF1Q8NBK3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUMF1Q8NBK3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUMF1Q8NBK3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUMF1Q8NBK3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUMF1Q8NBK3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUMF1Q8NBK3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUMF1Q8NBK3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUMF1Q8NBK3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUMF1Q8NBK3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUMF1Q8NBK3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SUMF1Q8NBK3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SUMF1Q8NBK3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUMF1Q8NBK3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUMF1Q8NBK3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUMF1Q8NBK3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SUMF1Q8NBK3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUMF1Q8NBK3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SUMF1Q8NBK3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUMF1Q8NBK3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUMF1Q8NBK3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUMF1Q8NBK3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SUMF1Q8NBK3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUMF1Q8NBK3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUMF1Q8NBK3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUMF1Q8NBK3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUMF1Q8NBK3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUMF1Q8NBK3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUMF1Q8NBK3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUMF1Q8NBK3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUMF1Q8NBK3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUMF1Q8NBK3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUMF1Q8NBK3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUMF1Q8NBK3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUMF1Q8NBK3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SUMF1Q8NBK3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUMF1Q8NBK3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUMF1Q8NBK3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUMF1Q8NBK3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUMF1Q8NBK3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUMF1Q8NBK3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUMF1Q8NBK3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUMF1Q8NBK3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUMF1Q8NBK3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUMF1Q8NBK3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUMF1Q8NBK3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUMF1Q8NBK3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUMF1Q8NBK3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SUMF1Q8NBK3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUMF1Q8NBK3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUMF1Q8NBK3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUMF1Q8NBK3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUMF1Q8NBK3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUMF1Q8NBK3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUMF1Q8NBK3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SUMF1Q8NBK3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUMF1Q8NBK3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUMF1Q8NBK3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SUMF1Q8NBK3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SUMF1Q8NBK3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SUMF1Q8NBK3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SUMF1Q8NBK3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SUMF1Q8NBK3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUMF1Q8NBK3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUMF1Q8NBK3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUMF1Q8NBK3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUMF1Q8NBK3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUMF1Q8NBK3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUMF1Q8NBK3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUMF1Q8NBK3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SUMF1Q8NBK3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUMF1Q8NBK3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUMF1Q8NBK3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUMF1Q8NBK3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUMF1Q8NBK3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SUMF1Q8NBK3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SUMF1Q8NBK3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SUMF1Q8NBK3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SUMF1Q8NBK3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUMF1Q8NBK3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUMF1Q8NBK3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SUMF1Q8NBK3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUMF1Q8NBK3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUMF1Q8NBK3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUMF1Q8NBK3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUMF1Q8NBK3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUMF1Q8NBK3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUMF1Q8NBK3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUMF1Q8NBK3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SUMF1Q8NBK3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUMF1Q8NBK3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUMF1Q8NBK3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUMF1Q8NBK3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUMF1Q8NBK3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUMF1Q8NBK3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUMF1Q8NBK3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUMF1Q8NBK3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUMF1Q8NBK3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUMF1Q8NBK3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms