Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB37

GATD1, Glutamine amidotransferase-like class 1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATD1Q8NB37 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATD1Q8NB37 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GATD1Q8NB37 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATD1Q8NB37 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATD1Q8NB37 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATD1Q8NB37 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATD1Q8NB37 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATD1Q8NB37 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATD1Q8NB37 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GATD1Q8NB37 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GATD1Q8NB37 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GATD1Q8NB37 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GATD1Q8NB37 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GATD1Q8NB37 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GATD1Q8NB37 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATD1Q8NB37 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GATD1Q8NB37 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GATD1Q8NB37 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GATD1Q8NB37 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GATD1Q8NB37 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GATD1Q8NB37 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GATD1Q8NB37 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GATD1Q8NB37 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GATD1Q8NB37 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GATD1Q8NB37 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GATD1Q8NB37 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATD1Q8NB37 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATD1Q8NB37 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATD1Q8NB37 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATD1Q8NB37 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATD1Q8NB37 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GATD1Q8NB37 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATD1Q8NB37 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATD1Q8NB37 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATD1Q8NB37 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATD1Q8NB37 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATD1Q8NB37 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GATD1Q8NB37 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GATD1Q8NB37 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GATD1Q8NB37 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATD1Q8NB37 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATD1Q8NB37 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GATD1Q8NB37 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATD1Q8NB37 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATD1Q8NB37 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GATD1Q8NB37 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATD1Q8NB37 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATD1Q8NB37 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATD1Q8NB37 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GATD1Q8NB37 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATD1Q8NB37 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATD1Q8NB37 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATD1Q8NB37 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATD1Q8NB37 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATD1Q8NB37 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATD1Q8NB37 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATD1Q8NB37 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATD1Q8NB37 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATD1Q8NB37 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATD1Q8NB37 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATD1Q8NB37 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATD1Q8NB37 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATD1Q8NB37 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GATD1Q8NB37 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GATD1Q8NB37 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATD1Q8NB37 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATD1Q8NB37 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATD1Q8NB37 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATD1Q8NB37 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATD1Q8NB37 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GATD1Q8NB37 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GATD1Q8NB37 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GATD1Q8NB37 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GATD1Q8NB37 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATD1Q8NB37 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATD1Q8NB37 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATD1Q8NB37 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GATD1Q8NB37 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GATD1Q8NB37 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GATD1Q8NB37 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GATD1Q8NB37 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GATD1Q8NB37 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GATD1Q8NB37 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GATD1Q8NB37 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GATD1Q8NB37 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GATD1Q8NB37 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GATD1Q8NB37 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GATD1Q8NB37 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GATD1Q8NB37 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GATD1Q8NB37 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GATD1Q8NB37 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GATD1Q8NB37 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GATD1Q8NB37 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GATD1Q8NB37 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GATD1Q8NB37 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GATD1Q8NB37 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GATD1Q8NB37 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GATD1Q8NB37 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GATD1Q8NB37 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GATD1Q8NB37 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms