Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z9

LMNTD1, Lamin tail domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD1Q8N9Z9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNTD1Q8N9Z9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNTD1Q8N9Z9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNTD1Q8N9Z9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNTD1Q8N9Z9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNTD1Q8N9Z9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNTD1Q8N9Z9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNTD1Q8N9Z9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNTD1Q8N9Z9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNTD1Q8N9Z9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNTD1Q8N9Z9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNTD1Q8N9Z9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNTD1Q8N9Z9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMNTD1Q8N9Z9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNTD1Q8N9Z9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNTD1Q8N9Z9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNTD1Q8N9Z9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMNTD1Q8N9Z9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMNTD1Q8N9Z9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMNTD1Q8N9Z9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMNTD1Q8N9Z9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNTD1Q8N9Z9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNTD1Q8N9Z9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNTD1Q8N9Z9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMNTD1Q8N9Z9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms