Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z9

LMNTD1, Lamin tail domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD1Q8N9Z9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNTD1Q8N9Z9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNTD1Q8N9Z9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNTD1Q8N9Z9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNTD1Q8N9Z9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNTD1Q8N9Z9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNTD1Q8N9Z9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LMNTD1Q8N9Z9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNTD1Q8N9Z9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNTD1Q8N9Z9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNTD1Q8N9Z9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNTD1Q8N9Z9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNTD1Q8N9Z9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNTD1Q8N9Z9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMNTD1Q8N9Z9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNTD1Q8N9Z9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNTD1Q8N9Z9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNTD1Q8N9Z9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMNTD1Q8N9Z9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMNTD1Q8N9Z9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMNTD1Q8N9Z9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMNTD1Q8N9Z9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNTD1Q8N9Z9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNTD1Q8N9Z9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNTD1Q8N9Z9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMNTD1Q8N9Z9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMNTD1Q8N9Z9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNTD1Q8N9Z9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms