Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B8

RASGEF1A, Ras-GEF domain-containing family member 1A, humanhuman

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1AQ8N9B8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RASGEF1AQ8N9B8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RASGEF1AQ8N9B8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RASGEF1AQ8N9B8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RASGEF1AQ8N9B8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RASGEF1AQ8N9B8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RASGEF1AQ8N9B8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RASGEF1AQ8N9B8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RASGEF1AQ8N9B8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RASGEF1AQ8N9B8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RASGEF1AQ8N9B8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RASGEF1AQ8N9B8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RASGEF1AQ8N9B8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RASGEF1AQ8N9B8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RASGEF1AQ8N9B8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RASGEF1AQ8N9B8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RASGEF1AQ8N9B8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RASGEF1AQ8N9B8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RASGEF1AQ8N9B8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RASGEF1AQ8N9B8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RASGEF1AQ8N9B8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RASGEF1AQ8N9B8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RASGEF1AQ8N9B8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RASGEF1AQ8N9B8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RASGEF1AQ8N9B8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RASGEF1AQ8N9B8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RASGEF1AQ8N9B8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RASGEF1AQ8N9B8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RASGEF1AQ8N9B8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RASGEF1AQ8N9B8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RASGEF1AQ8N9B8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RASGEF1AQ8N9B8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RASGEF1AQ8N9B8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RASGEF1AQ8N9B8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RASGEF1AQ8N9B8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RASGEF1AQ8N9B8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RASGEF1AQ8N9B8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RASGEF1AQ8N9B8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RASGEF1AQ8N9B8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RASGEF1AQ8N9B8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RASGEF1AQ8N9B8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RASGEF1AQ8N9B8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RASGEF1AQ8N9B8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RASGEF1AQ8N9B8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RASGEF1AQ8N9B8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RASGEF1AQ8N9B8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RASGEF1AQ8N9B8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RASGEF1AQ8N9B8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RASGEF1AQ8N9B8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RASGEF1AQ8N9B8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RASGEF1AQ8N9B8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RASGEF1AQ8N9B8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RASGEF1AQ8N9B8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RASGEF1AQ8N9B8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASGEF1AQ8N9B8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASGEF1AQ8N9B8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASGEF1AQ8N9B8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASGEF1AQ8N9B8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASGEF1AQ8N9B8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASGEF1AQ8N9B8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASGEF1AQ8N9B8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASGEF1AQ8N9B8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASGEF1AQ8N9B8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASGEF1AQ8N9B8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASGEF1AQ8N9B8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASGEF1AQ8N9B8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASGEF1AQ8N9B8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASGEF1AQ8N9B8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASGEF1AQ8N9B8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASGEF1AQ8N9B8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASGEF1AQ8N9B8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASGEF1AQ8N9B8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASGEF1AQ8N9B8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RASGEF1AQ8N9B8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RASGEF1AQ8N9B8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RASGEF1AQ8N9B8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RASGEF1AQ8N9B8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RASGEF1AQ8N9B8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RASGEF1AQ8N9B8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASGEF1AQ8N9B8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASGEF1AQ8N9B8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASGEF1AQ8N9B8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RASGEF1AQ8N9B8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASGEF1AQ8N9B8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASGEF1AQ8N9B8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASGEF1AQ8N9B8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASGEF1AQ8N9B8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASGEF1AQ8N9B8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RASGEF1AQ8N9B8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RASGEF1AQ8N9B8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RASGEF1AQ8N9B8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RASGEF1AQ8N9B8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RASGEF1AQ8N9B8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RASGEF1AQ8N9B8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RASGEF1AQ8N9B8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RASGEF1AQ8N9B8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RASGEF1AQ8N9B8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RASGEF1AQ8N9B8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASGEF1AQ8N9B8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASGEF1AQ8N9B8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
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