Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4N3

KLHL36, Kelch-like protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL36Q8N4N3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL36Q8N4N3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL36Q8N4N3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL36Q8N4N3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL36Q8N4N3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL36Q8N4N3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL36Q8N4N3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL36Q8N4N3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL36Q8N4N3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL36Q8N4N3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL36Q8N4N3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KLHL36Q8N4N3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL36Q8N4N3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL36Q8N4N3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL36Q8N4N3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL36Q8N4N3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL36Q8N4N3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL36Q8N4N3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL36Q8N4N3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL36Q8N4N3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL36Q8N4N3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL36Q8N4N3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL36Q8N4N3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL36Q8N4N3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL36Q8N4N3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL36Q8N4N3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL36Q8N4N3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL36Q8N4N3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL36Q8N4N3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL36Q8N4N3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL36Q8N4N3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL36Q8N4N3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL36Q8N4N3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL36Q8N4N3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL36Q8N4N3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL36Q8N4N3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL36Q8N4N3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL36Q8N4N3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL36Q8N4N3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL36Q8N4N3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL36Q8N4N3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL36Q8N4N3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL36Q8N4N3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL36Q8N4N3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL36Q8N4N3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL36Q8N4N3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL36Q8N4N3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL36Q8N4N3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL36Q8N4N3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL36Q8N4N3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL36Q8N4N3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL36Q8N4N3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL36Q8N4N3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL36Q8N4N3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL36Q8N4N3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL36Q8N4N3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL36Q8N4N3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL36Q8N4N3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL36Q8N4N3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL36Q8N4N3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL36Q8N4N3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL36Q8N4N3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL36Q8N4N3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL36Q8N4N3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL36Q8N4N3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL36Q8N4N3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL36Q8N4N3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL36Q8N4N3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL36Q8N4N3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL36Q8N4N3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL36Q8N4N3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL36Q8N4N3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL36Q8N4N3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL36Q8N4N3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL36Q8N4N3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL36Q8N4N3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL36Q8N4N3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL36Q8N4N3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL36Q8N4N3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL36Q8N4N3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL36Q8N4N3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL36Q8N4N3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL36Q8N4N3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL36Q8N4N3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL36Q8N4N3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL36Q8N4N3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL36Q8N4N3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL36Q8N4N3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL36Q8N4N3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL36Q8N4N3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL36Q8N4N3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL36Q8N4N3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL36Q8N4N3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL36Q8N4N3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL36Q8N4N3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL36Q8N4N3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL36Q8N4N3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL36Q8N4N3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL36Q8N4N3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL36Q8N4N3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms