Protein–RNA interactions for Protein: Q8N398

VWA5B2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B2Q8N398 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA5B2Q8N398 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA5B2Q8N398 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA5B2Q8N398 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA5B2Q8N398 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA5B2Q8N398 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA5B2Q8N398 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA5B2Q8N398 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA5B2Q8N398 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA5B2Q8N398 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA5B2Q8N398 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA5B2Q8N398 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA5B2Q8N398 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA5B2Q8N398 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA5B2Q8N398 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA5B2Q8N398 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA5B2Q8N398 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA5B2Q8N398 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA5B2Q8N398 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA5B2Q8N398 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA5B2Q8N398 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA5B2Q8N398 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA5B2Q8N398 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA5B2Q8N398 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA5B2Q8N398 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA5B2Q8N398 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA5B2Q8N398 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA5B2Q8N398 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VWA5B2Q8N398 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VWA5B2Q8N398 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VWA5B2Q8N398 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VWA5B2Q8N398 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VWA5B2Q8N398 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VWA5B2Q8N398 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VWA5B2Q8N398 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VWA5B2Q8N398 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
VWA5B2Q8N398 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA5B2Q8N398 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA5B2Q8N398 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA5B2Q8N398 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VWA5B2Q8N398 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VWA5B2Q8N398 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA5B2Q8N398 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA5B2Q8N398 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA5B2Q8N398 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA5B2Q8N398 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA5B2Q8N398 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA5B2Q8N398 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA5B2Q8N398 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VWA5B2Q8N398 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VWA5B2Q8N398 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VWA5B2Q8N398 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VWA5B2Q8N398 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA5B2Q8N398 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VWA5B2Q8N398 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VWA5B2Q8N398 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VWA5B2Q8N398 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA5B2Q8N398 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA5B2Q8N398 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA5B2Q8N398 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA5B2Q8N398 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA5B2Q8N398 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA5B2Q8N398 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA5B2Q8N398 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA5B2Q8N398 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA5B2Q8N398 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA5B2Q8N398 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA5B2Q8N398 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA5B2Q8N398 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA5B2Q8N398 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA5B2Q8N398 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA5B2Q8N398 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA5B2Q8N398 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA5B2Q8N398 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA5B2Q8N398 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA5B2Q8N398 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA5B2Q8N398 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA5B2Q8N398 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA5B2Q8N398 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA5B2Q8N398 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA5B2Q8N398 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA5B2Q8N398 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VWA5B2Q8N398 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VWA5B2Q8N398 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VWA5B2Q8N398 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VWA5B2Q8N398 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VWA5B2Q8N398 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VWA5B2Q8N398 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VWA5B2Q8N398 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VWA5B2Q8N398 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VWA5B2Q8N398 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA5B2Q8N398 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA5B2Q8N398 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA5B2Q8N398 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA5B2Q8N398 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA5B2Q8N398 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VWA5B2Q8N398 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VWA5B2Q8N398 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VWA5B2Q8N398 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VWA5B2Q8N398 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms