Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CDKL3Q8IVW4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDKL3Q8IVW4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDKL3Q8IVW4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CDKL3Q8IVW4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDKL3Q8IVW4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDKL3Q8IVW4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDKL3Q8IVW4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDKL3Q8IVW4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDKL3Q8IVW4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDKL3Q8IVW4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDKL3Q8IVW4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDKL3Q8IVW4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDKL3Q8IVW4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDKL3Q8IVW4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDKL3Q8IVW4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDKL3Q8IVW4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDKL3Q8IVW4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDKL3Q8IVW4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDKL3Q8IVW4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDKL3Q8IVW4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDKL3Q8IVW4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDKL3Q8IVW4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDKL3Q8IVW4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDKL3Q8IVW4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDKL3Q8IVW4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDKL3Q8IVW4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDKL3Q8IVW4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDKL3Q8IVW4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDKL3Q8IVW4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDKL3Q8IVW4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDKL3Q8IVW4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDKL3Q8IVW4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDKL3Q8IVW4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CDKL3Q8IVW4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CDKL3Q8IVW4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDKL3Q8IVW4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDKL3Q8IVW4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDKL3Q8IVW4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDKL3Q8IVW4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDKL3Q8IVW4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDKL3Q8IVW4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDKL3Q8IVW4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDKL3Q8IVW4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDKL3Q8IVW4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDKL3Q8IVW4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDKL3Q8IVW4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDKL3Q8IVW4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDKL3Q8IVW4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDKL3Q8IVW4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDKL3Q8IVW4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDKL3Q8IVW4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDKL3Q8IVW4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDKL3Q8IVW4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDKL3Q8IVW4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDKL3Q8IVW4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDKL3Q8IVW4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDKL3Q8IVW4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDKL3Q8IVW4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDKL3Q8IVW4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDKL3Q8IVW4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDKL3Q8IVW4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CDKL3Q8IVW4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDKL3Q8IVW4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDKL3Q8IVW4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDKL3Q8IVW4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDKL3Q8IVW4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDKL3Q8IVW4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDKL3Q8IVW4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDKL3Q8IVW4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDKL3Q8IVW4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CDKL3Q8IVW4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDKL3Q8IVW4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDKL3Q8IVW4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDKL3Q8IVW4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDKL3Q8IVW4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDKL3Q8IVW4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDKL3Q8IVW4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDKL3Q8IVW4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDKL3Q8IVW4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDKL3Q8IVW4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDKL3Q8IVW4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDKL3Q8IVW4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDKL3Q8IVW4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDKL3Q8IVW4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDKL3Q8IVW4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDKL3Q8IVW4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDKL3Q8IVW4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDKL3Q8IVW4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDKL3Q8IVW4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDKL3Q8IVW4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDKL3Q8IVW4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDKL3Q8IVW4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDKL3Q8IVW4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDKL3Q8IVW4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDKL3Q8IVW4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDKL3Q8IVW4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDKL3Q8IVW4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDKL3Q8IVW4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDKL3Q8IVW4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms