Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
HERC6Q8IVU3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HERC6Q8IVU3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HERC6Q8IVU3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
HERC6Q8IVU3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HERC6Q8IVU3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HERC6Q8IVU3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HERC6Q8IVU3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HERC6Q8IVU3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
HERC6Q8IVU3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
HERC6Q8IVU3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HERC6Q8IVU3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HERC6Q8IVU3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
HERC6Q8IVU3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
HERC6Q8IVU3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
HERC6Q8IVU3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HERC6Q8IVU3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HERC6Q8IVU3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HERC6Q8IVU3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HERC6Q8IVU3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
HERC6Q8IVU3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HERC6Q8IVU3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
HERC6Q8IVU3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HERC6Q8IVU3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HERC6Q8IVU3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HERC6Q8IVU3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HERC6Q8IVU3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HERC6Q8IVU3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HERC6Q8IVU3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HERC6Q8IVU3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HERC6Q8IVU3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HERC6Q8IVU3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HERC6Q8IVU3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HERC6Q8IVU3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HERC6Q8IVU3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
HERC6Q8IVU3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HERC6Q8IVU3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HERC6Q8IVU3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HERC6Q8IVU3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HERC6Q8IVU3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HERC6Q8IVU3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HERC6Q8IVU3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HERC6Q8IVU3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HERC6Q8IVU3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HERC6Q8IVU3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HERC6Q8IVU3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HERC6Q8IVU3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HERC6Q8IVU3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HERC6Q8IVU3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HERC6Q8IVU3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HERC6Q8IVU3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HERC6Q8IVU3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HERC6Q8IVU3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HERC6Q8IVU3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HERC6Q8IVU3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HERC6Q8IVU3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HERC6Q8IVU3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HERC6Q8IVU3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HERC6Q8IVU3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
HERC6Q8IVU3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HERC6Q8IVU3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HERC6Q8IVU3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HERC6Q8IVU3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HERC6Q8IVU3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HERC6Q8IVU3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HERC6Q8IVU3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HERC6Q8IVU3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HERC6Q8IVU3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HERC6Q8IVU3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HERC6Q8IVU3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HERC6Q8IVU3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HERC6Q8IVU3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HERC6Q8IVU3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HERC6Q8IVU3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HERC6Q8IVU3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HERC6Q8IVU3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HERC6Q8IVU3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HERC6Q8IVU3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HERC6Q8IVU3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HERC6Q8IVU3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HERC6Q8IVU3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HERC6Q8IVU3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HERC6Q8IVU3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HERC6Q8IVU3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HERC6Q8IVU3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HERC6Q8IVU3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HERC6Q8IVU3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
HERC6Q8IVU3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HERC6Q8IVU3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
HERC6Q8IVU3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HERC6Q8IVU3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HERC6Q8IVU3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HERC6Q8IVU3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HERC6Q8IVU3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HERC6Q8IVU3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HERC6Q8IVU3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HERC6Q8IVU3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HERC6Q8IVU3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HERC6Q8IVU3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HERC6Q8IVU3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms