Protein–RNA interactions for Protein: Q86X52

CHSY1, Chondroitin sulfate synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY1Q86X52 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHSY1Q86X52 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHSY1Q86X52 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHSY1Q86X52 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHSY1Q86X52 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHSY1Q86X52 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHSY1Q86X52 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHSY1Q86X52 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHSY1Q86X52 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHSY1Q86X52 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHSY1Q86X52 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHSY1Q86X52 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHSY1Q86X52 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CHSY1Q86X52 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHSY1Q86X52 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHSY1Q86X52 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHSY1Q86X52 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHSY1Q86X52 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHSY1Q86X52 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHSY1Q86X52 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHSY1Q86X52 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHSY1Q86X52 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHSY1Q86X52 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHSY1Q86X52 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHSY1Q86X52 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHSY1Q86X52 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHSY1Q86X52 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHSY1Q86X52 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHSY1Q86X52 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHSY1Q86X52 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHSY1Q86X52 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHSY1Q86X52 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHSY1Q86X52 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHSY1Q86X52 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHSY1Q86X52 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHSY1Q86X52 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHSY1Q86X52 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHSY1Q86X52 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHSY1Q86X52 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHSY1Q86X52 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHSY1Q86X52 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHSY1Q86X52 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CHSY1Q86X52 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHSY1Q86X52 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHSY1Q86X52 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHSY1Q86X52 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHSY1Q86X52 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHSY1Q86X52 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHSY1Q86X52 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHSY1Q86X52 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHSY1Q86X52 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHSY1Q86X52 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHSY1Q86X52 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHSY1Q86X52 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHSY1Q86X52 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHSY1Q86X52 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHSY1Q86X52 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHSY1Q86X52 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHSY1Q86X52 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CHSY1Q86X52 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHSY1Q86X52 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHSY1Q86X52 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHSY1Q86X52 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHSY1Q86X52 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHSY1Q86X52 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHSY1Q86X52 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHSY1Q86X52 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHSY1Q86X52 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHSY1Q86X52 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHSY1Q86X52 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHSY1Q86X52 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHSY1Q86X52 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHSY1Q86X52 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHSY1Q86X52 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHSY1Q86X52 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHSY1Q86X52 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHSY1Q86X52 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHSY1Q86X52 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CHSY1Q86X52 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHSY1Q86X52 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHSY1Q86X52 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CHSY1Q86X52 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHSY1Q86X52 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHSY1Q86X52 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHSY1Q86X52 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHSY1Q86X52 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CHSY1Q86X52 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHSY1Q86X52 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHSY1Q86X52 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHSY1Q86X52 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHSY1Q86X52 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHSY1Q86X52 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHSY1Q86X52 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHSY1Q86X52 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHSY1Q86X52 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHSY1Q86X52 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHSY1Q86X52 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHSY1Q86X52 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHSY1Q86X52 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHSY1Q86X52 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms