Protein–RNA interactions for Protein: Q86W54

SPATA24, Spermatogenesis-associated protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA24Q86W54 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA24Q86W54 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA24Q86W54 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA24Q86W54 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATA24Q86W54 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATA24Q86W54 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATA24Q86W54 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATA24Q86W54 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATA24Q86W54 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATA24Q86W54 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPATA24Q86W54 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPATA24Q86W54 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPATA24Q86W54 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPATA24Q86W54 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPATA24Q86W54 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPATA24Q86W54 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPATA24Q86W54 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPATA24Q86W54 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPATA24Q86W54 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPATA24Q86W54 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPATA24Q86W54 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
SPATA24Q86W54 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPATA24Q86W54 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPATA24Q86W54 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPATA24Q86W54 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPATA24Q86W54 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPATA24Q86W54 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPATA24Q86W54 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPATA24Q86W54 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SPATA24Q86W54 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SPATA24Q86W54 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SPATA24Q86W54 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SPATA24Q86W54 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPATA24Q86W54 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPATA24Q86W54 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA24Q86W54 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA24Q86W54 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPATA24Q86W54 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPATA24Q86W54 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SPATA24Q86W54 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPATA24Q86W54 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPATA24Q86W54 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPATA24Q86W54 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPATA24Q86W54 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPATA24Q86W54 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPATA24Q86W54 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPATA24Q86W54 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPATA24Q86W54 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPATA24Q86W54 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPATA24Q86W54 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPATA24Q86W54 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPATA24Q86W54 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPATA24Q86W54 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPATA24Q86W54 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATA24Q86W54 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATA24Q86W54 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATA24Q86W54 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA24Q86W54 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA24Q86W54 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA24Q86W54 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA24Q86W54 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA24Q86W54 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA24Q86W54 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA24Q86W54 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA24Q86W54 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATA24Q86W54 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATA24Q86W54 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA24Q86W54 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA24Q86W54 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA24Q86W54 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPATA24Q86W54 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPATA24Q86W54 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPATA24Q86W54 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPATA24Q86W54 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPATA24Q86W54 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPATA24Q86W54 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPATA24Q86W54 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPATA24Q86W54 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPATA24Q86W54 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA24Q86W54 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA24Q86W54 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA24Q86W54 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA24Q86W54 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA24Q86W54 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA24Q86W54 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA24Q86W54 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA24Q86W54 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA24Q86W54 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA24Q86W54 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPATA24Q86W54 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPATA24Q86W54 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPATA24Q86W54 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPATA24Q86W54 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPATA24Q86W54 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPATA24Q86W54 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPATA24Q86W54 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SPATA24Q86W54 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPATA24Q86W54 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPATA24Q86W54 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPATA24Q86W54 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms