Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT5

PDZD3, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD3Q86UT5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZD3Q86UT5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZD3Q86UT5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZD3Q86UT5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZD3Q86UT5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZD3Q86UT5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZD3Q86UT5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZD3Q86UT5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZD3Q86UT5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZD3Q86UT5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZD3Q86UT5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZD3Q86UT5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZD3Q86UT5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDZD3Q86UT5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDZD3Q86UT5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZD3Q86UT5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZD3Q86UT5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZD3Q86UT5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZD3Q86UT5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZD3Q86UT5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZD3Q86UT5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZD3Q86UT5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZD3Q86UT5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZD3Q86UT5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZD3Q86UT5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZD3Q86UT5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZD3Q86UT5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZD3Q86UT5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZD3Q86UT5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZD3Q86UT5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZD3Q86UT5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZD3Q86UT5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZD3Q86UT5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZD3Q86UT5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZD3Q86UT5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZD3Q86UT5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZD3Q86UT5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZD3Q86UT5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZD3Q86UT5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZD3Q86UT5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZD3Q86UT5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZD3Q86UT5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZD3Q86UT5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZD3Q86UT5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZD3Q86UT5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZD3Q86UT5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZD3Q86UT5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZD3Q86UT5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZD3Q86UT5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZD3Q86UT5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZD3Q86UT5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZD3Q86UT5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZD3Q86UT5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZD3Q86UT5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZD3Q86UT5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZD3Q86UT5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZD3Q86UT5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZD3Q86UT5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZD3Q86UT5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZD3Q86UT5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZD3Q86UT5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZD3Q86UT5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZD3Q86UT5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZD3Q86UT5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZD3Q86UT5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZD3Q86UT5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZD3Q86UT5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZD3Q86UT5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZD3Q86UT5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZD3Q86UT5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZD3Q86UT5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDZD3Q86UT5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDZD3Q86UT5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDZD3Q86UT5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDZD3Q86UT5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZD3Q86UT5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZD3Q86UT5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZD3Q86UT5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZD3Q86UT5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZD3Q86UT5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZD3Q86UT5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZD3Q86UT5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZD3Q86UT5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZD3Q86UT5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZD3Q86UT5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZD3Q86UT5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZD3Q86UT5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZD3Q86UT5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZD3Q86UT5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZD3Q86UT5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZD3Q86UT5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZD3Q86UT5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZD3Q86UT5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZD3Q86UT5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZD3Q86UT5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZD3Q86UT5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZD3Q86UT5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZD3Q86UT5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDZD3Q86UT5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDZD3Q86UT5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms