Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CMC1Q7Z7K0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CMC1Q7Z7K0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CMC1Q7Z7K0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CMC1Q7Z7K0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CMC1Q7Z7K0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CMC1Q7Z7K0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CMC1Q7Z7K0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CMC1Q7Z7K0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CMC1Q7Z7K0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CMC1Q7Z7K0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CMC1Q7Z7K0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CMC1Q7Z7K0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CMC1Q7Z7K0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CMC1Q7Z7K0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CMC1Q7Z7K0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CMC1Q7Z7K0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CMC1Q7Z7K0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CMC1Q7Z7K0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CMC1Q7Z7K0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CMC1Q7Z7K0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CMC1Q7Z7K0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CMC1Q7Z7K0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CMC1Q7Z7K0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CMC1Q7Z7K0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CMC1Q7Z7K0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CMC1Q7Z7K0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CMC1Q7Z7K0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CMC1Q7Z7K0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CMC1Q7Z7K0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CMC1Q7Z7K0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CMC1Q7Z7K0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CMC1Q7Z7K0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CMC1Q7Z7K0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CMC1Q7Z7K0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CMC1Q7Z7K0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CMC1Q7Z7K0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CMC1Q7Z7K0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CMC1Q7Z7K0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CMC1Q7Z7K0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CMC1Q7Z7K0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CMC1Q7Z7K0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CMC1Q7Z7K0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CMC1Q7Z7K0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CMC1Q7Z7K0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CMC1Q7Z7K0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CMC1Q7Z7K0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CMC1Q7Z7K0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CMC1Q7Z7K0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CMC1Q7Z7K0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CMC1Q7Z7K0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CMC1Q7Z7K0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CMC1Q7Z7K0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CMC1Q7Z7K0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CMC1Q7Z7K0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CMC1Q7Z7K0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CMC1Q7Z7K0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CMC1Q7Z7K0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CMC1Q7Z7K0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CMC1Q7Z7K0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CMC1Q7Z7K0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CMC1Q7Z7K0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CMC1Q7Z7K0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CMC1Q7Z7K0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CMC1Q7Z7K0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CMC1Q7Z7K0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CMC1Q7Z7K0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CMC1Q7Z7K0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CMC1Q7Z7K0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CMC1Q7Z7K0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CMC1Q7Z7K0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CMC1Q7Z7K0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CMC1Q7Z7K0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CMC1Q7Z7K0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CMC1Q7Z7K0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CMC1Q7Z7K0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CMC1Q7Z7K0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CMC1Q7Z7K0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CMC1Q7Z7K0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CMC1Q7Z7K0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CMC1Q7Z7K0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CMC1Q7Z7K0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CMC1Q7Z7K0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CMC1Q7Z7K0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CMC1Q7Z7K0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CMC1Q7Z7K0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CMC1Q7Z7K0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CMC1Q7Z7K0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CMC1Q7Z7K0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CMC1Q7Z7K0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CMC1Q7Z7K0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CMC1Q7Z7K0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CMC1Q7Z7K0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CMC1Q7Z7K0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CMC1Q7Z7K0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CMC1Q7Z7K0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CMC1Q7Z7K0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CMC1Q7Z7K0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CMC1Q7Z7K0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CMC1Q7Z7K0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms