Protein–RNA interactions for Protein: Q71UM5

RPS27L, 40S ribosomal protein S27-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27LQ71UM5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS27LQ71UM5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS27LQ71UM5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS27LQ71UM5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS27LQ71UM5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS27LQ71UM5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS27LQ71UM5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS27LQ71UM5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS27LQ71UM5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS27LQ71UM5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS27LQ71UM5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS27LQ71UM5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS27LQ71UM5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS27LQ71UM5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RPS27LQ71UM5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS27LQ71UM5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS27LQ71UM5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS27LQ71UM5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS27LQ71UM5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS27LQ71UM5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS27LQ71UM5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS27LQ71UM5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS27LQ71UM5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS27LQ71UM5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS27LQ71UM5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS27LQ71UM5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS27LQ71UM5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS27LQ71UM5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS27LQ71UM5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS27LQ71UM5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS27LQ71UM5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS27LQ71UM5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS27LQ71UM5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS27LQ71UM5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS27LQ71UM5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS27LQ71UM5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS27LQ71UM5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS27LQ71UM5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS27LQ71UM5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS27LQ71UM5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS27LQ71UM5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS27LQ71UM5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS27LQ71UM5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS27LQ71UM5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS27LQ71UM5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS27LQ71UM5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS27LQ71UM5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS27LQ71UM5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS27LQ71UM5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS27LQ71UM5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS27LQ71UM5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS27LQ71UM5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS27LQ71UM5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS27LQ71UM5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS27LQ71UM5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS27LQ71UM5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS27LQ71UM5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS27LQ71UM5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS27LQ71UM5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS27LQ71UM5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
RPS27LQ71UM5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RPS27LQ71UM5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RPS27LQ71UM5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS27LQ71UM5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS27LQ71UM5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS27LQ71UM5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS27LQ71UM5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS27LQ71UM5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS27LQ71UM5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS27LQ71UM5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS27LQ71UM5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS27LQ71UM5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS27LQ71UM5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS27LQ71UM5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS27LQ71UM5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS27LQ71UM5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS27LQ71UM5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS27LQ71UM5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS27LQ71UM5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS27LQ71UM5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS27LQ71UM5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS27LQ71UM5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS27LQ71UM5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS27LQ71UM5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS27LQ71UM5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS27LQ71UM5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPS27LQ71UM5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPS27LQ71UM5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS27LQ71UM5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS27LQ71UM5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS27LQ71UM5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS27LQ71UM5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS27LQ71UM5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS27LQ71UM5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS27LQ71UM5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS27LQ71UM5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS27LQ71UM5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS27LQ71UM5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS27LQ71UM5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS27LQ71UM5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms