Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM43BQ6ZT52 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM43BQ6ZT52 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM43BQ6ZT52 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM43BQ6ZT52 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM43BQ6ZT52 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM43BQ6ZT52 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM43BQ6ZT52 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM43BQ6ZT52 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM43BQ6ZT52 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM43BQ6ZT52 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM43BQ6ZT52 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM43BQ6ZT52 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM43BQ6ZT52 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM43BQ6ZT52 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM43BQ6ZT52 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM43BQ6ZT52 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM43BQ6ZT52 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM43BQ6ZT52 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM43BQ6ZT52 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM43BQ6ZT52 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM43BQ6ZT52 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM43BQ6ZT52 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM43BQ6ZT52 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM43BQ6ZT52 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM43BQ6ZT52 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM43BQ6ZT52 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM43BQ6ZT52 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM43BQ6ZT52 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM43BQ6ZT52 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM43BQ6ZT52 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM43BQ6ZT52 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM43BQ6ZT52 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM43BQ6ZT52 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM43BQ6ZT52 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM43BQ6ZT52 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM43BQ6ZT52 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FAM43BQ6ZT52 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM43BQ6ZT52 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM43BQ6ZT52 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM43BQ6ZT52 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM43BQ6ZT52 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM43BQ6ZT52 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM43BQ6ZT52 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM43BQ6ZT52 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM43BQ6ZT52 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM43BQ6ZT52 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM43BQ6ZT52 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM43BQ6ZT52 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM43BQ6ZT52 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM43BQ6ZT52 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM43BQ6ZT52 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM43BQ6ZT52 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM43BQ6ZT52 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM43BQ6ZT52 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM43BQ6ZT52 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM43BQ6ZT52 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM43BQ6ZT52 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAM43BQ6ZT52 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAM43BQ6ZT52 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAM43BQ6ZT52 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
FAM43BQ6ZT52 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM43BQ6ZT52 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM43BQ6ZT52 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM43BQ6ZT52 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM43BQ6ZT52 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM43BQ6ZT52 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM43BQ6ZT52 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM43BQ6ZT52 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM43BQ6ZT52 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM43BQ6ZT52 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM43BQ6ZT52 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM43BQ6ZT52 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM43BQ6ZT52 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM43BQ6ZT52 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM43BQ6ZT52 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM43BQ6ZT52 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM43BQ6ZT52 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM43BQ6ZT52 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM43BQ6ZT52 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM43BQ6ZT52 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM43BQ6ZT52 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM43BQ6ZT52 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM43BQ6ZT52 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM43BQ6ZT52 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM43BQ6ZT52 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM43BQ6ZT52 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM43BQ6ZT52 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM43BQ6ZT52 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM43BQ6ZT52 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM43BQ6ZT52 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
FAM43BQ6ZT52 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FAM43BQ6ZT52 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FAM43BQ6ZT52 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FAM43BQ6ZT52 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM43BQ6ZT52 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM43BQ6ZT52 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM43BQ6ZT52 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM43BQ6ZT52 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM43BQ6ZT52 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
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