Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQR2

CFAP77, Cilia- and flagella-associated protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP77Q6ZQR2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP77Q6ZQR2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP77Q6ZQR2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP77Q6ZQR2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP77Q6ZQR2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP77Q6ZQR2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP77Q6ZQR2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP77Q6ZQR2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP77Q6ZQR2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP77Q6ZQR2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP77Q6ZQR2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP77Q6ZQR2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP77Q6ZQR2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP77Q6ZQR2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP77Q6ZQR2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP77Q6ZQR2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP77Q6ZQR2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP77Q6ZQR2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP77Q6ZQR2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP77Q6ZQR2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP77Q6ZQR2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP77Q6ZQR2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP77Q6ZQR2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP77Q6ZQR2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP77Q6ZQR2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP77Q6ZQR2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP77Q6ZQR2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP77Q6ZQR2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP77Q6ZQR2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP77Q6ZQR2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP77Q6ZQR2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP77Q6ZQR2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP77Q6ZQR2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP77Q6ZQR2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP77Q6ZQR2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP77Q6ZQR2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP77Q6ZQR2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CFAP77Q6ZQR2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CFAP77Q6ZQR2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP77Q6ZQR2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP77Q6ZQR2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP77Q6ZQR2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP77Q6ZQR2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP77Q6ZQR2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP77Q6ZQR2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP77Q6ZQR2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP77Q6ZQR2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP77Q6ZQR2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP77Q6ZQR2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP77Q6ZQR2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP77Q6ZQR2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP77Q6ZQR2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP77Q6ZQR2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP77Q6ZQR2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP77Q6ZQR2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP77Q6ZQR2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP77Q6ZQR2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP77Q6ZQR2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP77Q6ZQR2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP77Q6ZQR2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP77Q6ZQR2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP77Q6ZQR2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP77Q6ZQR2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP77Q6ZQR2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP77Q6ZQR2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP77Q6ZQR2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP77Q6ZQR2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP77Q6ZQR2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP77Q6ZQR2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP77Q6ZQR2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP77Q6ZQR2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP77Q6ZQR2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP77Q6ZQR2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP77Q6ZQR2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP77Q6ZQR2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP77Q6ZQR2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP77Q6ZQR2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP77Q6ZQR2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP77Q6ZQR2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP77Q6ZQR2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP77Q6ZQR2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP77Q6ZQR2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP77Q6ZQR2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP77Q6ZQR2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP77Q6ZQR2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP77Q6ZQR2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP77Q6ZQR2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP77Q6ZQR2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP77Q6ZQR2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP77Q6ZQR2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP77Q6ZQR2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP77Q6ZQR2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP77Q6ZQR2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP77Q6ZQR2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP77Q6ZQR2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP77Q6ZQR2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP77Q6ZQR2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP77Q6ZQR2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP77Q6ZQR2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP77Q6ZQR2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms