Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GBP6Q6ZN66 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GBP6Q6ZN66 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GBP6Q6ZN66 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GBP6Q6ZN66 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GBP6Q6ZN66 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GBP6Q6ZN66 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GBP6Q6ZN66 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GBP6Q6ZN66 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
GBP6Q6ZN66 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GBP6Q6ZN66 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GBP6Q6ZN66 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GBP6Q6ZN66 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GBP6Q6ZN66 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GBP6Q6ZN66 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GBP6Q6ZN66 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GBP6Q6ZN66 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GBP6Q6ZN66 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GBP6Q6ZN66 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GBP6Q6ZN66 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GBP6Q6ZN66 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GBP6Q6ZN66 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GBP6Q6ZN66 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GBP6Q6ZN66 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GBP6Q6ZN66 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GBP6Q6ZN66 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GBP6Q6ZN66 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GBP6Q6ZN66 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GBP6Q6ZN66 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GBP6Q6ZN66 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GBP6Q6ZN66 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GBP6Q6ZN66 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GBP6Q6ZN66 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GBP6Q6ZN66 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GBP6Q6ZN66 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GBP6Q6ZN66 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GBP6Q6ZN66 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GBP6Q6ZN66 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GBP6Q6ZN66 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GBP6Q6ZN66 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GBP6Q6ZN66 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GBP6Q6ZN66 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GBP6Q6ZN66 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GBP6Q6ZN66 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GBP6Q6ZN66 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GBP6Q6ZN66 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GBP6Q6ZN66 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GBP6Q6ZN66 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GBP6Q6ZN66 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GBP6Q6ZN66 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GBP6Q6ZN66 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GBP6Q6ZN66 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GBP6Q6ZN66 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GBP6Q6ZN66 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GBP6Q6ZN66 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GBP6Q6ZN66 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GBP6Q6ZN66 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GBP6Q6ZN66 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GBP6Q6ZN66 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GBP6Q6ZN66 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GBP6Q6ZN66 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GBP6Q6ZN66 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GBP6Q6ZN66 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GBP6Q6ZN66 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GBP6Q6ZN66 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GBP6Q6ZN66 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GBP6Q6ZN66 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GBP6Q6ZN66 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GBP6Q6ZN66 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GBP6Q6ZN66 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GBP6Q6ZN66 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GBP6Q6ZN66 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GBP6Q6ZN66 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GBP6Q6ZN66 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GBP6Q6ZN66 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GBP6Q6ZN66 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GBP6Q6ZN66 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GBP6Q6ZN66 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GBP6Q6ZN66 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GBP6Q6ZN66 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GBP6Q6ZN66 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GBP6Q6ZN66 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GBP6Q6ZN66 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GBP6Q6ZN66 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GBP6Q6ZN66 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GBP6Q6ZN66 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
GBP6Q6ZN66 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GBP6Q6ZN66 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GBP6Q6ZN66 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GBP6Q6ZN66 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GBP6Q6ZN66 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GBP6Q6ZN66 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GBP6Q6ZN66 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GBP6Q6ZN66 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GBP6Q6ZN66 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GBP6Q6ZN66 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GBP6Q6ZN66 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GBP6Q6ZN66 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GBP6Q6ZN66 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GBP6Q6ZN66 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms