Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN30

BNC2, Zinc finger protein basonuclin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC2Q6ZN30 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BNC2Q6ZN30 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BNC2Q6ZN30 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BNC2Q6ZN30 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BNC2Q6ZN30 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BNC2Q6ZN30 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BNC2Q6ZN30 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BNC2Q6ZN30 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BNC2Q6ZN30 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BNC2Q6ZN30 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BNC2Q6ZN30 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BNC2Q6ZN30 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BNC2Q6ZN30 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BNC2Q6ZN30 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BNC2Q6ZN30 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BNC2Q6ZN30 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BNC2Q6ZN30 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BNC2Q6ZN30 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BNC2Q6ZN30 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BNC2Q6ZN30 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BNC2Q6ZN30 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BNC2Q6ZN30 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BNC2Q6ZN30 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BNC2Q6ZN30 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BNC2Q6ZN30 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BNC2Q6ZN30 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BNC2Q6ZN30 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BNC2Q6ZN30 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BNC2Q6ZN30 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BNC2Q6ZN30 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BNC2Q6ZN30 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BNC2Q6ZN30 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BNC2Q6ZN30 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BNC2Q6ZN30 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BNC2Q6ZN30 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BNC2Q6ZN30 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BNC2Q6ZN30 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BNC2Q6ZN30 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BNC2Q6ZN30 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BNC2Q6ZN30 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BNC2Q6ZN30 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BNC2Q6ZN30 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BNC2Q6ZN30 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BNC2Q6ZN30 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BNC2Q6ZN30 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BNC2Q6ZN30 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BNC2Q6ZN30 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BNC2Q6ZN30 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BNC2Q6ZN30 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BNC2Q6ZN30 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BNC2Q6ZN30 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BNC2Q6ZN30 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BNC2Q6ZN30 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BNC2Q6ZN30 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BNC2Q6ZN30 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BNC2Q6ZN30 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BNC2Q6ZN30 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BNC2Q6ZN30 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BNC2Q6ZN30 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BNC2Q6ZN30 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BNC2Q6ZN30 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BNC2Q6ZN30 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BNC2Q6ZN30 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BNC2Q6ZN30 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BNC2Q6ZN30 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BNC2Q6ZN30 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BNC2Q6ZN30 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BNC2Q6ZN30 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BNC2Q6ZN30 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BNC2Q6ZN30 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BNC2Q6ZN30 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BNC2Q6ZN30 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BNC2Q6ZN30 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BNC2Q6ZN30 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BNC2Q6ZN30 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BNC2Q6ZN30 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BNC2Q6ZN30 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BNC2Q6ZN30 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BNC2Q6ZN30 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BNC2Q6ZN30 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BNC2Q6ZN30 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BNC2Q6ZN30 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BNC2Q6ZN30 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BNC2Q6ZN30 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BNC2Q6ZN30 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BNC2Q6ZN30 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BNC2Q6ZN30 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BNC2Q6ZN30 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BNC2Q6ZN30 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BNC2Q6ZN30 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BNC2Q6ZN30 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BNC2Q6ZN30 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BNC2Q6ZN30 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BNC2Q6ZN30 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BNC2Q6ZN30 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BNC2Q6ZN30 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNC2Q6ZN30 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNC2Q6ZN30 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNC2Q6ZN30 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNC2Q6ZN30 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms