Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VITQ6UXI7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VITQ6UXI7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VITQ6UXI7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VITQ6UXI7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
VITQ6UXI7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VITQ6UXI7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VITQ6UXI7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VITQ6UXI7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
VITQ6UXI7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VITQ6UXI7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VITQ6UXI7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VITQ6UXI7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VITQ6UXI7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VITQ6UXI7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VITQ6UXI7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VITQ6UXI7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VITQ6UXI7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VITQ6UXI7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VITQ6UXI7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VITQ6UXI7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
VITQ6UXI7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VITQ6UXI7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VITQ6UXI7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VITQ6UXI7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VITQ6UXI7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VITQ6UXI7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VITQ6UXI7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VITQ6UXI7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VITQ6UXI7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VITQ6UXI7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VITQ6UXI7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
VITQ6UXI7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VITQ6UXI7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VITQ6UXI7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VITQ6UXI7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VITQ6UXI7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VITQ6UXI7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VITQ6UXI7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VITQ6UXI7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VITQ6UXI7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VITQ6UXI7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VITQ6UXI7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VITQ6UXI7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VITQ6UXI7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VITQ6UXI7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VITQ6UXI7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VITQ6UXI7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VITQ6UXI7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VITQ6UXI7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VITQ6UXI7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VITQ6UXI7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VITQ6UXI7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VITQ6UXI7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VITQ6UXI7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VITQ6UXI7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VITQ6UXI7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VITQ6UXI7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VITQ6UXI7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VITQ6UXI7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VITQ6UXI7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VITQ6UXI7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VITQ6UXI7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26■■□□□ 1.75
VITQ6UXI7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
VITQ6UXI7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26■■□□□ 1.75
VITQ6UXI7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26■■□□□ 1.75
VITQ6UXI7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VITQ6UXI7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VITQ6UXI7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VITQ6UXI7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
VITQ6UXI7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VITQ6UXI7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
VITQ6UXI7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VITQ6UXI7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VITQ6UXI7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VITQ6UXI7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VITQ6UXI7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VITQ6UXI7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VITQ6UXI7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VITQ6UXI7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VITQ6UXI7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
VITQ6UXI7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VITQ6UXI7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
VITQ6UXI7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VITQ6UXI7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VITQ6UXI7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VITQ6UXI7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms