Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HRCT1Q6UXD1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HRCT1Q6UXD1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HRCT1Q6UXD1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms