Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CXCL17Q6UXB2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CXCL17Q6UXB2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CXCL17Q6UXB2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CXCL17Q6UXB2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CXCL17Q6UXB2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CXCL17Q6UXB2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CXCL17Q6UXB2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CXCL17Q6UXB2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CXCL17Q6UXB2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CXCL17Q6UXB2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CXCL17Q6UXB2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CXCL17Q6UXB2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CXCL17Q6UXB2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CXCL17Q6UXB2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CXCL17Q6UXB2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CXCL17Q6UXB2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CXCL17Q6UXB2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CXCL17Q6UXB2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CXCL17Q6UXB2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CXCL17Q6UXB2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CXCL17Q6UXB2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CXCL17Q6UXB2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CXCL17Q6UXB2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CXCL17Q6UXB2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CXCL17Q6UXB2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CXCL17Q6UXB2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CXCL17Q6UXB2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CXCL17Q6UXB2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CXCL17Q6UXB2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CXCL17Q6UXB2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CXCL17Q6UXB2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CXCL17Q6UXB2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CXCL17Q6UXB2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CXCL17Q6UXB2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CXCL17Q6UXB2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CXCL17Q6UXB2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CXCL17Q6UXB2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CXCL17Q6UXB2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CXCL17Q6UXB2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CXCL17Q6UXB2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CXCL17Q6UXB2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CXCL17Q6UXB2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CXCL17Q6UXB2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CXCL17Q6UXB2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CXCL17Q6UXB2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CXCL17Q6UXB2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CXCL17Q6UXB2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CXCL17Q6UXB2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CXCL17Q6UXB2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CXCL17Q6UXB2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CXCL17Q6UXB2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CXCL17Q6UXB2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CXCL17Q6UXB2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CXCL17Q6UXB2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CXCL17Q6UXB2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CXCL17Q6UXB2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CXCL17Q6UXB2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CXCL17Q6UXB2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CXCL17Q6UXB2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CXCL17Q6UXB2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CXCL17Q6UXB2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CXCL17Q6UXB2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CXCL17Q6UXB2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CXCL17Q6UXB2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CXCL17Q6UXB2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CXCL17Q6UXB2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CXCL17Q6UXB2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CXCL17Q6UXB2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CXCL17Q6UXB2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CXCL17Q6UXB2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CXCL17Q6UXB2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CXCL17Q6UXB2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CXCL17Q6UXB2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CXCL17Q6UXB2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CXCL17Q6UXB2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
CXCL17Q6UXB2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CXCL17Q6UXB2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CXCL17Q6UXB2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CXCL17Q6UXB2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CXCL17Q6UXB2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CXCL17Q6UXB2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CXCL17Q6UXB2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CXCL17Q6UXB2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CXCL17Q6UXB2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CXCL17Q6UXB2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CXCL17Q6UXB2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CXCL17Q6UXB2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CXCL17Q6UXB2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CXCL17Q6UXB2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CXCL17Q6UXB2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CXCL17Q6UXB2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CXCL17Q6UXB2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CXCL17Q6UXB2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CXCL17Q6UXB2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CXCL17Q6UXB2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CXCL17Q6UXB2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CXCL17Q6UXB2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CXCL17Q6UXB2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CXCL17Q6UXB2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms