Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKC3

TXNDC11, Thioredoxin domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC11Q6PKC3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TXNDC11Q6PKC3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TXNDC11Q6PKC3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TXNDC11Q6PKC3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TXNDC11Q6PKC3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TXNDC11Q6PKC3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TXNDC11Q6PKC3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TXNDC11Q6PKC3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TXNDC11Q6PKC3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TXNDC11Q6PKC3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TXNDC11Q6PKC3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TXNDC11Q6PKC3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TXNDC11Q6PKC3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TXNDC11Q6PKC3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TXNDC11Q6PKC3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TXNDC11Q6PKC3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TXNDC11Q6PKC3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TXNDC11Q6PKC3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TXNDC11Q6PKC3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TXNDC11Q6PKC3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TXNDC11Q6PKC3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TXNDC11Q6PKC3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TXNDC11Q6PKC3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TXNDC11Q6PKC3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TXNDC11Q6PKC3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TXNDC11Q6PKC3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TXNDC11Q6PKC3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TXNDC11Q6PKC3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TXNDC11Q6PKC3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TXNDC11Q6PKC3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TXNDC11Q6PKC3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TXNDC11Q6PKC3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TXNDC11Q6PKC3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TXNDC11Q6PKC3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TXNDC11Q6PKC3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TXNDC11Q6PKC3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TXNDC11Q6PKC3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TXNDC11Q6PKC3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TXNDC11Q6PKC3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TXNDC11Q6PKC3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TXNDC11Q6PKC3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TXNDC11Q6PKC3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TXNDC11Q6PKC3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TXNDC11Q6PKC3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TXNDC11Q6PKC3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TXNDC11Q6PKC3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TXNDC11Q6PKC3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TXNDC11Q6PKC3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TXNDC11Q6PKC3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TXNDC11Q6PKC3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TXNDC11Q6PKC3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TXNDC11Q6PKC3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TXNDC11Q6PKC3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TXNDC11Q6PKC3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TXNDC11Q6PKC3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TXNDC11Q6PKC3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TXNDC11Q6PKC3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TXNDC11Q6PKC3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TXNDC11Q6PKC3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TXNDC11Q6PKC3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TXNDC11Q6PKC3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TXNDC11Q6PKC3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TXNDC11Q6PKC3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TXNDC11Q6PKC3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TXNDC11Q6PKC3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TXNDC11Q6PKC3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TXNDC11Q6PKC3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TXNDC11Q6PKC3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TXNDC11Q6PKC3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TXNDC11Q6PKC3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TXNDC11Q6PKC3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TXNDC11Q6PKC3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TXNDC11Q6PKC3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TXNDC11Q6PKC3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TXNDC11Q6PKC3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TXNDC11Q6PKC3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TXNDC11Q6PKC3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TXNDC11Q6PKC3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TXNDC11Q6PKC3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TXNDC11Q6PKC3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TXNDC11Q6PKC3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TXNDC11Q6PKC3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TXNDC11Q6PKC3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TXNDC11Q6PKC3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TXNDC11Q6PKC3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TXNDC11Q6PKC3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TXNDC11Q6PKC3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TXNDC11Q6PKC3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TXNDC11Q6PKC3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TXNDC11Q6PKC3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TXNDC11Q6PKC3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TXNDC11Q6PKC3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TXNDC11Q6PKC3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TXNDC11Q6PKC3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TXNDC11Q6PKC3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TXNDC11Q6PKC3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TXNDC11Q6PKC3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TXNDC11Q6PKC3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TXNDC11Q6PKC3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TXNDC11Q6PKC3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms