Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBA3EQ6PEY2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBA3EQ6PEY2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBA3EQ6PEY2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBA3EQ6PEY2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBA3EQ6PEY2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBA3EQ6PEY2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBA3EQ6PEY2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBA3EQ6PEY2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBA3EQ6PEY2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBA3EQ6PEY2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBA3EQ6PEY2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBA3EQ6PEY2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBA3EQ6PEY2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBA3EQ6PEY2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBA3EQ6PEY2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBA3EQ6PEY2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBA3EQ6PEY2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBA3EQ6PEY2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBA3EQ6PEY2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBA3EQ6PEY2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBA3EQ6PEY2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBA3EQ6PEY2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBA3EQ6PEY2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TUBA3EQ6PEY2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBA3EQ6PEY2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBA3EQ6PEY2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBA3EQ6PEY2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBA3EQ6PEY2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBA3EQ6PEY2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBA3EQ6PEY2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBA3EQ6PEY2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBA3EQ6PEY2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBA3EQ6PEY2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBA3EQ6PEY2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBA3EQ6PEY2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBA3EQ6PEY2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBA3EQ6PEY2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBA3EQ6PEY2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBA3EQ6PEY2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBA3EQ6PEY2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBA3EQ6PEY2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBA3EQ6PEY2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBA3EQ6PEY2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBA3EQ6PEY2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBA3EQ6PEY2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBA3EQ6PEY2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBA3EQ6PEY2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBA3EQ6PEY2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBA3EQ6PEY2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBA3EQ6PEY2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBA3EQ6PEY2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBA3EQ6PEY2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBA3EQ6PEY2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBA3EQ6PEY2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBA3EQ6PEY2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBA3EQ6PEY2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBA3EQ6PEY2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBA3EQ6PEY2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBA3EQ6PEY2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBA3EQ6PEY2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms