Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKN3Q6P5Z2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKN3Q6P5Z2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKN3Q6P5Z2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PKN3Q6P5Z2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKN3Q6P5Z2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKN3Q6P5Z2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKN3Q6P5Z2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKN3Q6P5Z2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKN3Q6P5Z2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PKN3Q6P5Z2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PKN3Q6P5Z2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PKN3Q6P5Z2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PKN3Q6P5Z2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKN3Q6P5Z2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKN3Q6P5Z2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKN3Q6P5Z2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PKN3Q6P5Z2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKN3Q6P5Z2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKN3Q6P5Z2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKN3Q6P5Z2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKN3Q6P5Z2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKN3Q6P5Z2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKN3Q6P5Z2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKN3Q6P5Z2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKN3Q6P5Z2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKN3Q6P5Z2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PKN3Q6P5Z2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKN3Q6P5Z2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKN3Q6P5Z2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKN3Q6P5Z2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PKN3Q6P5Z2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKN3Q6P5Z2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKN3Q6P5Z2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKN3Q6P5Z2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PKN3Q6P5Z2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PKN3Q6P5Z2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKN3Q6P5Z2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PKN3Q6P5Z2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKN3Q6P5Z2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKN3Q6P5Z2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKN3Q6P5Z2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKN3Q6P5Z2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PKN3Q6P5Z2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKN3Q6P5Z2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PKN3Q6P5Z2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKN3Q6P5Z2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKN3Q6P5Z2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKN3Q6P5Z2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKN3Q6P5Z2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PKN3Q6P5Z2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKN3Q6P5Z2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKN3Q6P5Z2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKN3Q6P5Z2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PKN3Q6P5Z2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKN3Q6P5Z2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKN3Q6P5Z2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PKN3Q6P5Z2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKN3Q6P5Z2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKN3Q6P5Z2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKN3Q6P5Z2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKN3Q6P5Z2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKN3Q6P5Z2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKN3Q6P5Z2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKN3Q6P5Z2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKN3Q6P5Z2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKN3Q6P5Z2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKN3Q6P5Z2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PKN3Q6P5Z2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKN3Q6P5Z2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PKN3Q6P5Z2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PKN3Q6P5Z2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PKN3Q6P5Z2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PKN3Q6P5Z2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PKN3Q6P5Z2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PKN3Q6P5Z2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PKN3Q6P5Z2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PKN3Q6P5Z2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PKN3Q6P5Z2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKN3Q6P5Z2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKN3Q6P5Z2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PKN3Q6P5Z2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKN3Q6P5Z2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKN3Q6P5Z2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKN3Q6P5Z2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKN3Q6P5Z2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKN3Q6P5Z2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PKN3Q6P5Z2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKN3Q6P5Z2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PKN3Q6P5Z2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKN3Q6P5Z2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKN3Q6P5Z2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKN3Q6P5Z2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKN3Q6P5Z2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKN3Q6P5Z2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKN3Q6P5Z2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKN3Q6P5Z2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKN3Q6P5Z2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKN3Q6P5Z2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKN3Q6P5Z2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms