Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKK2

TTC19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19Q6DKK2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC19Q6DKK2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC19Q6DKK2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC19Q6DKK2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC19Q6DKK2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC19Q6DKK2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC19Q6DKK2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC19Q6DKK2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC19Q6DKK2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC19Q6DKK2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC19Q6DKK2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC19Q6DKK2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC19Q6DKK2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC19Q6DKK2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TTC19Q6DKK2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC19Q6DKK2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC19Q6DKK2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC19Q6DKK2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC19Q6DKK2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC19Q6DKK2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC19Q6DKK2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC19Q6DKK2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC19Q6DKK2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC19Q6DKK2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC19Q6DKK2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC19Q6DKK2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC19Q6DKK2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC19Q6DKK2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC19Q6DKK2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC19Q6DKK2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC19Q6DKK2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC19Q6DKK2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC19Q6DKK2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC19Q6DKK2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC19Q6DKK2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC19Q6DKK2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC19Q6DKK2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC19Q6DKK2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC19Q6DKK2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC19Q6DKK2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC19Q6DKK2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC19Q6DKK2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC19Q6DKK2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC19Q6DKK2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC19Q6DKK2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC19Q6DKK2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC19Q6DKK2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC19Q6DKK2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC19Q6DKK2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC19Q6DKK2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC19Q6DKK2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC19Q6DKK2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC19Q6DKK2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC19Q6DKK2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC19Q6DKK2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC19Q6DKK2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC19Q6DKK2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC19Q6DKK2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC19Q6DKK2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC19Q6DKK2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TTC19Q6DKK2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TTC19Q6DKK2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC19Q6DKK2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC19Q6DKK2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC19Q6DKK2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC19Q6DKK2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC19Q6DKK2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC19Q6DKK2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC19Q6DKK2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC19Q6DKK2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC19Q6DKK2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC19Q6DKK2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC19Q6DKK2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC19Q6DKK2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC19Q6DKK2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC19Q6DKK2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC19Q6DKK2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC19Q6DKK2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC19Q6DKK2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC19Q6DKK2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC19Q6DKK2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC19Q6DKK2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC19Q6DKK2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC19Q6DKK2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC19Q6DKK2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC19Q6DKK2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC19Q6DKK2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC19Q6DKK2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC19Q6DKK2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC19Q6DKK2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC19Q6DKK2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC19Q6DKK2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC19Q6DKK2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC19Q6DKK2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC19Q6DKK2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC19Q6DKK2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC19Q6DKK2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC19Q6DKK2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC19Q6DKK2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TTC19Q6DKK2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms