Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHEQ5VZ18 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHEQ5VZ18 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SHEQ5VZ18 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHEQ5VZ18 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHEQ5VZ18 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHEQ5VZ18 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHEQ5VZ18 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SHEQ5VZ18 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SHEQ5VZ18 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SHEQ5VZ18 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHEQ5VZ18 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SHEQ5VZ18 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHEQ5VZ18 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHEQ5VZ18 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHEQ5VZ18 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHEQ5VZ18 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHEQ5VZ18 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHEQ5VZ18 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHEQ5VZ18 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHEQ5VZ18 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHEQ5VZ18 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHEQ5VZ18 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHEQ5VZ18 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHEQ5VZ18 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SHEQ5VZ18 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHEQ5VZ18 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHEQ5VZ18 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHEQ5VZ18 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHEQ5VZ18 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHEQ5VZ18 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHEQ5VZ18 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHEQ5VZ18 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHEQ5VZ18 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHEQ5VZ18 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHEQ5VZ18 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHEQ5VZ18 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHEQ5VZ18 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHEQ5VZ18 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHEQ5VZ18 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHEQ5VZ18 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHEQ5VZ18 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHEQ5VZ18 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SHEQ5VZ18 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHEQ5VZ18 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHEQ5VZ18 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHEQ5VZ18 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHEQ5VZ18 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHEQ5VZ18 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHEQ5VZ18 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SHEQ5VZ18 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SHEQ5VZ18 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHEQ5VZ18 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHEQ5VZ18 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHEQ5VZ18 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHEQ5VZ18 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHEQ5VZ18 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHEQ5VZ18 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHEQ5VZ18 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHEQ5VZ18 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHEQ5VZ18 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHEQ5VZ18 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHEQ5VZ18 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHEQ5VZ18 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHEQ5VZ18 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHEQ5VZ18 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHEQ5VZ18 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHEQ5VZ18 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHEQ5VZ18 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHEQ5VZ18 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHEQ5VZ18 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHEQ5VZ18 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SHEQ5VZ18 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHEQ5VZ18 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHEQ5VZ18 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHEQ5VZ18 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHEQ5VZ18 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHEQ5VZ18 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHEQ5VZ18 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHEQ5VZ18 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHEQ5VZ18 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHEQ5VZ18 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHEQ5VZ18 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHEQ5VZ18 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHEQ5VZ18 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SHEQ5VZ18 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHEQ5VZ18 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHEQ5VZ18 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHEQ5VZ18 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHEQ5VZ18 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHEQ5VZ18 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHEQ5VZ18 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHEQ5VZ18 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHEQ5VZ18 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHEQ5VZ18 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHEQ5VZ18 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SHEQ5VZ18 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHEQ5VZ18 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHEQ5VZ18 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHEQ5VZ18 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms