Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLX4IPQ5VYV7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLX4IPQ5VYV7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLX4IPQ5VYV7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLX4IPQ5VYV7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLX4IPQ5VYV7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLX4IPQ5VYV7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLX4IPQ5VYV7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLX4IPQ5VYV7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLX4IPQ5VYV7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLX4IPQ5VYV7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLX4IPQ5VYV7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLX4IPQ5VYV7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLX4IPQ5VYV7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLX4IPQ5VYV7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLX4IPQ5VYV7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLX4IPQ5VYV7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLX4IPQ5VYV7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLX4IPQ5VYV7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLX4IPQ5VYV7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLX4IPQ5VYV7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLX4IPQ5VYV7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLX4IPQ5VYV7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLX4IPQ5VYV7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLX4IPQ5VYV7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX4IPQ5VYV7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX4IPQ5VYV7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX4IPQ5VYV7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX4IPQ5VYV7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLX4IPQ5VYV7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLX4IPQ5VYV7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLX4IPQ5VYV7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLX4IPQ5VYV7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLX4IPQ5VYV7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLX4IPQ5VYV7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLX4IPQ5VYV7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLX4IPQ5VYV7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLX4IPQ5VYV7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLX4IPQ5VYV7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLX4IPQ5VYV7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLX4IPQ5VYV7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLX4IPQ5VYV7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLX4IPQ5VYV7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLX4IPQ5VYV7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLX4IPQ5VYV7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLX4IPQ5VYV7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLX4IPQ5VYV7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLX4IPQ5VYV7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLX4IPQ5VYV7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLX4IPQ5VYV7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLX4IPQ5VYV7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLX4IPQ5VYV7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLX4IPQ5VYV7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLX4IPQ5VYV7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLX4IPQ5VYV7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLX4IPQ5VYV7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLX4IPQ5VYV7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLX4IPQ5VYV7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLX4IPQ5VYV7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLX4IPQ5VYV7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLX4IPQ5VYV7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLX4IPQ5VYV7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLX4IPQ5VYV7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLX4IPQ5VYV7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLX4IPQ5VYV7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLX4IPQ5VYV7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLX4IPQ5VYV7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLX4IPQ5VYV7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLX4IPQ5VYV7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLX4IPQ5VYV7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLX4IPQ5VYV7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLX4IPQ5VYV7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLX4IPQ5VYV7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLX4IPQ5VYV7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLX4IPQ5VYV7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLX4IPQ5VYV7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLX4IPQ5VYV7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLX4IPQ5VYV7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLX4IPQ5VYV7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLX4IPQ5VYV7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLX4IPQ5VYV7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLX4IPQ5VYV7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLX4IPQ5VYV7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLX4IPQ5VYV7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLX4IPQ5VYV7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLX4IPQ5VYV7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLX4IPQ5VYV7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLX4IPQ5VYV7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLX4IPQ5VYV7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLX4IPQ5VYV7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLX4IPQ5VYV7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLX4IPQ5VYV7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLX4IPQ5VYV7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLX4IPQ5VYV7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLX4IPQ5VYV7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLX4IPQ5VYV7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLX4IPQ5VYV7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLX4IPQ5VYV7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLX4IPQ5VYV7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLX4IPQ5VYV7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms