Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
CHIC1Q5VXU3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
CHIC1Q5VXU3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
CHIC1Q5VXU3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC42.92■■■■■ 4.46
CHIC1Q5VXU3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
CHIC1Q5VXU3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
CHIC1Q5VXU3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
CHIC1Q5VXU3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
CHIC1Q5VXU3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
CHIC1Q5VXU3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC42.91■■■■■ 4.46
CHIC1Q5VXU3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC42.89■■■■■ 4.46
CHIC1Q5VXU3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC42.89■■■■■ 4.46
CHIC1Q5VXU3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
CHIC1Q5VXU3 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC42.88■■■■■ 4.45
CHIC1Q5VXU3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
CHIC1Q5VXU3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
CHIC1Q5VXU3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
CHIC1Q5VXU3 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC42.86■■■■■ 4.45
CHIC1Q5VXU3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
CHIC1Q5VXU3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC42.85■■■■■ 4.45
CHIC1Q5VXU3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
CHIC1Q5VXU3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
CHIC1Q5VXU3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
CHIC1Q5VXU3 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC42.84■■■■■ 4.45
CHIC1Q5VXU3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC42.84■■■■■ 4.45
CHIC1Q5VXU3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC42.84■■■■■ 4.45
CHIC1Q5VXU3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC42.83■■■■■ 4.45
CHIC1Q5VXU3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC42.82■■■■■ 4.45
CHIC1Q5VXU3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.8■■■■■ 4.44
CHIC1Q5VXU3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
CHIC1Q5VXU3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC42.8■■■■■ 4.44
CHIC1Q5VXU3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
CHIC1Q5VXU3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
CHIC1Q5VXU3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC42.78■■■■■ 4.44
CHIC1Q5VXU3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC42.77■■■■■ 4.44
CHIC1Q5VXU3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC42.77■■■■■ 4.44
CHIC1Q5VXU3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC42.77■■■■■ 4.44
CHIC1Q5VXU3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
CHIC1Q5VXU3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC42.76■■■■■ 4.44
CHIC1Q5VXU3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
CHIC1Q5VXU3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
CHIC1Q5VXU3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC42.75■■■■■ 4.43
CHIC1Q5VXU3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
CHIC1Q5VXU3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.74■■■■■ 4.43
CHIC1Q5VXU3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC42.74■■■■■ 4.43
CHIC1Q5VXU3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC42.73■■■■■ 4.43
CHIC1Q5VXU3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
CHIC1Q5VXU3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.73■■■■■ 4.43
CHIC1Q5VXU3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC42.73■■■■■ 4.43
CHIC1Q5VXU3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
CHIC1Q5VXU3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
CHIC1Q5VXU3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
CHIC1Q5VXU3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
CHIC1Q5VXU3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC42.71■■■■■ 4.43
CHIC1Q5VXU3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC42.71■■■■■ 4.43
CHIC1Q5VXU3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
CHIC1Q5VXU3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
CHIC1Q5VXU3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC42.7■■■■■ 4.43
CHIC1Q5VXU3 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC42.7■■■■■ 4.43
CHIC1Q5VXU3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
CHIC1Q5VXU3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
CHIC1Q5VXU3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
CHIC1Q5VXU3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
CHIC1Q5VXU3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
CHIC1Q5VXU3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
CHIC1Q5VXU3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC42.68■■■■■ 4.42
CHIC1Q5VXU3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.68■■■■■ 4.42
CHIC1Q5VXU3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
CHIC1Q5VXU3 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC42.66■■■■■ 4.42
CHIC1Q5VXU3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC42.66■■■■■ 4.42
CHIC1Q5VXU3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
CHIC1Q5VXU3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
CHIC1Q5VXU3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC42.65■■■■■ 4.42
CHIC1Q5VXU3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC42.65■■■■■ 4.42
CHIC1Q5VXU3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
CHIC1Q5VXU3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
CHIC1Q5VXU3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
CHIC1Q5VXU3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
CHIC1Q5VXU3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.42
CHIC1Q5VXU3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
CHIC1Q5VXU3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC42.62■■■■■ 4.41
CHIC1Q5VXU3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
CHIC1Q5VXU3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.6■■■■■ 4.41
CHIC1Q5VXU3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
CHIC1Q5VXU3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.6■■■■■ 4.41
CHIC1Q5VXU3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
CHIC1Q5VXU3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
CHIC1Q5VXU3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.59■■■■■ 4.41
CHIC1Q5VXU3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC42.58■■■■■ 4.41
CHIC1Q5VXU3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.58■■■■■ 4.41
CHIC1Q5VXU3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC42.58■■■■■ 4.41
CHIC1Q5VXU3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
CHIC1Q5VXU3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
CHIC1Q5VXU3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC42.57■■■■■ 4.41
CHIC1Q5VXU3 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC42.57■■■■■ 4.41
CHIC1Q5VXU3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
CHIC1Q5VXU3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
CHIC1Q5VXU3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
CHIC1Q5VXU3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
CHIC1Q5VXU3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 445.6 ms