Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF6Q5VXH4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF6Q5VXH4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF6Q5VXH4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF6Q5VXH4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF6Q5VXH4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF6Q5VXH4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF6Q5VXH4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF6Q5VXH4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF6Q5VXH4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF6Q5VXH4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF6Q5VXH4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF6Q5VXH4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF6Q5VXH4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF6Q5VXH4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF6Q5VXH4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF6Q5VXH4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF6Q5VXH4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF6Q5VXH4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF6Q5VXH4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF6Q5VXH4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF6Q5VXH4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF6Q5VXH4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF6Q5VXH4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF6Q5VXH4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF6Q5VXH4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF6Q5VXH4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF6Q5VXH4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF6Q5VXH4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF6Q5VXH4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF6Q5VXH4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF6Q5VXH4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF6Q5VXH4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF6Q5VXH4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF6Q5VXH4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF6Q5VXH4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF6Q5VXH4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF6Q5VXH4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF6Q5VXH4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF6Q5VXH4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF6Q5VXH4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF6Q5VXH4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF6Q5VXH4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF6Q5VXH4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF6Q5VXH4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF6Q5VXH4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF6Q5VXH4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF6Q5VXH4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF6Q5VXH4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF6Q5VXH4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF6Q5VXH4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF6Q5VXH4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF6Q5VXH4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF6Q5VXH4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF6Q5VXH4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF6Q5VXH4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF6Q5VXH4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF6Q5VXH4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF6Q5VXH4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF6Q5VXH4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF6Q5VXH4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF6Q5VXH4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF6Q5VXH4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF6Q5VXH4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PRAMEF6Q5VXH4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF6Q5VXH4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF6Q5VXH4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF6Q5VXH4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF6Q5VXH4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF6Q5VXH4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF6Q5VXH4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF6Q5VXH4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF6Q5VXH4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF6Q5VXH4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF6Q5VXH4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF6Q5VXH4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF6Q5VXH4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF6Q5VXH4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF6Q5VXH4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF6Q5VXH4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF6Q5VXH4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF6Q5VXH4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF6Q5VXH4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF6Q5VXH4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF6Q5VXH4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF6Q5VXH4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF6Q5VXH4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF6Q5VXH4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF6Q5VXH4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF6Q5VXH4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF6Q5VXH4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF6Q5VXH4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF6Q5VXH4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF6Q5VXH4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PRAMEF6Q5VXH4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRAMEF6Q5VXH4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRAMEF6Q5VXH4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms