Protein–RNA interactions for Protein: Q5TKA1

LIN9, Protein lin-9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN9Q5TKA1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LIN9Q5TKA1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LIN9Q5TKA1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LIN9Q5TKA1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
LIN9Q5TKA1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LIN9Q5TKA1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LIN9Q5TKA1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LIN9Q5TKA1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LIN9Q5TKA1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LIN9Q5TKA1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LIN9Q5TKA1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LIN9Q5TKA1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LIN9Q5TKA1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LIN9Q5TKA1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LIN9Q5TKA1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LIN9Q5TKA1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LIN9Q5TKA1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LIN9Q5TKA1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LIN9Q5TKA1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LIN9Q5TKA1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LIN9Q5TKA1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LIN9Q5TKA1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LIN9Q5TKA1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LIN9Q5TKA1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LIN9Q5TKA1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LIN9Q5TKA1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LIN9Q5TKA1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LIN9Q5TKA1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LIN9Q5TKA1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LIN9Q5TKA1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LIN9Q5TKA1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LIN9Q5TKA1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LIN9Q5TKA1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LIN9Q5TKA1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LIN9Q5TKA1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LIN9Q5TKA1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LIN9Q5TKA1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LIN9Q5TKA1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LIN9Q5TKA1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LIN9Q5TKA1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LIN9Q5TKA1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LIN9Q5TKA1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LIN9Q5TKA1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LIN9Q5TKA1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LIN9Q5TKA1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LIN9Q5TKA1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LIN9Q5TKA1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LIN9Q5TKA1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LIN9Q5TKA1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LIN9Q5TKA1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LIN9Q5TKA1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LIN9Q5TKA1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LIN9Q5TKA1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LIN9Q5TKA1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LIN9Q5TKA1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LIN9Q5TKA1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LIN9Q5TKA1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LIN9Q5TKA1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LIN9Q5TKA1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LIN9Q5TKA1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LIN9Q5TKA1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LIN9Q5TKA1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LIN9Q5TKA1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LIN9Q5TKA1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LIN9Q5TKA1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LIN9Q5TKA1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LIN9Q5TKA1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LIN9Q5TKA1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LIN9Q5TKA1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LIN9Q5TKA1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LIN9Q5TKA1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LIN9Q5TKA1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LIN9Q5TKA1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LIN9Q5TKA1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LIN9Q5TKA1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LIN9Q5TKA1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LIN9Q5TKA1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LIN9Q5TKA1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LIN9Q5TKA1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LIN9Q5TKA1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LIN9Q5TKA1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LIN9Q5TKA1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LIN9Q5TKA1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LIN9Q5TKA1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LIN9Q5TKA1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LIN9Q5TKA1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LIN9Q5TKA1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LIN9Q5TKA1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LIN9Q5TKA1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LIN9Q5TKA1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LIN9Q5TKA1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LIN9Q5TKA1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LIN9Q5TKA1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LIN9Q5TKA1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LIN9Q5TKA1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LIN9Q5TKA1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LIN9Q5TKA1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LIN9Q5TKA1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LIN9Q5TKA1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LIN9Q5TKA1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms