Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGU0

TSPO2, Translocator protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPO2Q5TGU0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPO2Q5TGU0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPO2Q5TGU0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPO2Q5TGU0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPO2Q5TGU0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPO2Q5TGU0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPO2Q5TGU0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPO2Q5TGU0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPO2Q5TGU0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPO2Q5TGU0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPO2Q5TGU0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPO2Q5TGU0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPO2Q5TGU0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPO2Q5TGU0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPO2Q5TGU0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPO2Q5TGU0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPO2Q5TGU0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPO2Q5TGU0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPO2Q5TGU0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPO2Q5TGU0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPO2Q5TGU0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPO2Q5TGU0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPO2Q5TGU0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPO2Q5TGU0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPO2Q5TGU0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPO2Q5TGU0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPO2Q5TGU0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPO2Q5TGU0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPO2Q5TGU0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPO2Q5TGU0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPO2Q5TGU0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPO2Q5TGU0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPO2Q5TGU0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPO2Q5TGU0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPO2Q5TGU0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPO2Q5TGU0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPO2Q5TGU0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPO2Q5TGU0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPO2Q5TGU0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPO2Q5TGU0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPO2Q5TGU0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPO2Q5TGU0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPO2Q5TGU0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPO2Q5TGU0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPO2Q5TGU0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPO2Q5TGU0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPO2Q5TGU0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPO2Q5TGU0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPO2Q5TGU0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPO2Q5TGU0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPO2Q5TGU0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPO2Q5TGU0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSPO2Q5TGU0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPO2Q5TGU0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPO2Q5TGU0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPO2Q5TGU0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPO2Q5TGU0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPO2Q5TGU0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPO2Q5TGU0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms